23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 191


Base Pair (191:206)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* -- 0.1 74.1* 3.2 0.1* 1.4 4.5 -- -- -- 0.1 -- -- -- 0.2 15.7839
3 -- -- -- 94.0 5.6 -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- --486
B -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --271
A -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E -- -- -- 83.8 15.1 -- 0.6 -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- --179
M 1.6* -- 0.4 25.7* -- 0.4* 4.3 15.0 -- -- -- -- -- -- -- 0.8 51.9253
 
Base Pair (192:205)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 36.9* 4.9* 1.4 0.5* 10.6 0.8 2.9* 1.2 5.4 4.6 4.9 0.1 6.1 3.0 2.0 14.7839
3 -- 50.2* 7.6* 0.4* 0.4 6.6 0.2 -- 1.9 8.2 3.3 6.8 -- 8.4 3.7 2.3 --486
B -- 76.4* -- -- 0.7* 5.2 -- -- -- -- -- 2.6 -- 15.1 -- -- --271
A -- 50.0 -- -- -- 25.0 -- -- 25.0 -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- 49.0 -- -- -- 47.0 -- -- -- -- -- 2.0 -- 2.0 -- -- --100
E -- 10.6 20.7 1.1* -- 5.0 0.6 -- -- 22.3* 8.9 14.5 -- -- 10.1* 6.1 --179
M 0.4 6.7* 1.6 4.0 0.8 4.0 2.4 9.5* 0.4 2.0 9.1 2.4 0.4* 3.2 2.8 2.4* 48.3253
 
Base Pair (193:204)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.4 72.5* 0.1 0.2* 0.5 0.5 -- 0.1* 1.5 3.1* 1.7 1.8 -- 1.9 1.5 14.2839
3 -- -- 94.7* -- 0.4* 0.2 0.8 -- -- 0.4 -- -- 3.1 -- -- 0.4 --486
B -- -- 99.3 -- -- -- -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- --271
A -- -- 47.2* -- 5.6* -- 5.6 -- -- -- -- -- 41.7 -- -- -- --36
C -- -- 98.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0100
E -- -- 97.2 -- -- 0.6 1.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.1 --179
M -- 1.2 19.8* 0.4 -- 1.2 -- -- 0.4* 4.3 10.3* 5.5 -- -- 6.3 4.3 46.3253
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)