23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 191
Base Pair (191:206)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.5* | -- |
0.1 | 74.1* |
3.2 | 0.1* |
1.4 | 4.5 | -- | -- |
-- | 0.1 | -- | -- |
-- | 0.2 | 15.7 | 839 |
3 |
-- | -- |
-- | 94.0 |
5.6 | -- |
0.2 | -- | -- | -- |
-- | 0.2 | -- | -- |
-- | -- | -- | 486 |
B |
-- | -- |
-- | 100.0 |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 271 |
A |
-- | -- | -- |
100.0 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 36 |
C |
-- | -- | -- |
100.0 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 100 |
E |
-- | -- | -- |
83.8 | 15.1 | -- |
0.6 | -- | -- | -- |
-- | 0.6 | -- | -- |
-- | -- | -- | 179 |
M |
1.6* | -- |
0.4 | 25.7* |
-- | 0.4* |
4.3 | 15.0 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 0.8 | 51.9 | 253 |
|
Base Pair (192:205)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.1 | 36.9* |
4.9* | 1.4 |
0.5* | 10.6 |
0.8 | 2.9* | 1.2 | 5.4 |
4.6 | 4.9 | 0.1 | 6.1 |
3.0 | 2.0 | 14.7 | 839 |
3 |
-- | 50.2* |
7.6* | 0.4* |
0.4 | 6.6 |
0.2 | -- | 1.9 | 8.2 |
3.3 | 6.8 | -- | 8.4 |
3.7 | 2.3 | -- | 486 |
B |
-- | 76.4* |
-- | -- |
0.7* | 5.2 |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.6 | -- | 15.1 |
-- | -- | -- | 271 |
A |
-- | 50.0 |
-- | -- |
-- | 25.0 |
-- | -- | 25.0 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 36 |
C |
-- | 49.0 |
-- | -- |
-- | 47.0 |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.0 | -- | 2.0 |
-- | -- | -- | 100 |
E |
-- | 10.6 |
20.7 | 1.1* |
-- | 5.0 |
0.6 | -- | -- | 22.3* |
8.9 | 14.5 | -- | -- |
10.1* | 6.1 | -- | 179 |
M |
0.4 | 6.7* |
1.6 | 4.0 |
0.8 | 4.0 |
2.4 | 9.5* | 0.4 | 2.0 |
9.1 | 2.4 | 0.4* | 3.2 |
2.8 | 2.4* | 48.3 | 253 |
|
Base Pair (193:204)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- | 0.4 |
72.5* | 0.1 |
0.2* | 0.5 |
0.5 | -- | 0.1* | 1.5 |
3.1* | 1.7 | 1.8 | -- |
1.9 | 1.5 | 14.2 | 839 |
3 |
-- | -- |
94.7* | -- |
0.4* | 0.2 |
0.8 | -- | -- | 0.4 |
-- | -- | 3.1 | -- |
-- | 0.4 | -- | 486 |
B |
-- | -- |
99.3 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 0.7 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 271 |
A |
-- | -- |
47.2* | -- |
5.6* | -- |
5.6 | -- | -- | -- |
-- | -- | 41.7 | -- |
-- | -- | -- | 36 |
C |
-- | -- |
98.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 2.0 | 100 |
E |
-- | -- |
97.2 | -- |
-- | 0.6 |
1.1 | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 1.1 | -- | 179 |
M |
-- | 1.2 |
19.8* | 0.4 |
-- | 1.2 |
-- | -- | 0.4* | 4.3 |
10.3* | 5.5 | -- | -- |
6.3 | 4.3 | 46.3 | 253 |
|
Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)