23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 1927
| Base Pair (1927:1944)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
76.4* |
-- |
-- |
3.1 |
18.4 |
-- |
-- |
0.1* |
0.4 |
0.1* |
-- |
-- |
1.1 |
0.4 | 847 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
63.4* |
-- |
-- |
0.7 |
35.2 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 435 |
| B |
-- |
-- |
-- |
98.7* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- | 239 |
| A |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
86.8 |
-- |
-- |
7.4 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
0.9 | 311 |
| |
| Base Pair (1928:1943)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
98.7 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 847 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- | 436 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 240 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
-- |
96.8 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- | 310 |
| |
| Base Pair (1929:1942)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
78.7* |
-- |
0.5* |
1.1* |
8.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.1 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
-- | 848 |
| 3 |
99.5* |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 436 |
| B |
99.6* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
58.4 |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
36.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
55.9* |
-- |
1.0* |
2.9* |
22.5 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
15.8 |
0.6 |
0.3 |
0.6 |
-- | 311 |
| |
| Base Pair (1930:1941)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
67.8* |
-- |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- | 848 |
| 3 |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 436 |
| B |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- | 155 |
| M |
13.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.5 |
-- |
-- |
-- |
-- | 311 |
| |
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