23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2028


Base Pair (2028:2035)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 0.6 5.7 -- -- 68.6* 0.1 -- 0.1 -- -- 0.5* 0.4* 17.6 0.5 5.5 0.3848
3 0.2 1.1 2.3 -- -- 51.6* -- -- 0.2 -- -- 0.5* 0.7* 34.2 0.5 8.3 0.4436
B -- 0.4 3.8 -- -- 90.0 -- -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.8 4.6 --240
A -- 9.8* 2.4 -- -- 22.0 -- -- -- -- -- 4.9 -- -- -- 61.0* --41
C -- -- 3.0 -- -- 94.1 -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0 -- 1.0101
E 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 96.1 -- -- 1.2155
M -- -- 11.3 -- -- 84.2* 0.3* -- -- -- -- 0.6* -- -- -- 3.5 --311
 
Base Pair (2029:2034)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.8 -- 1.5 4.1 41.9* 0.7* 2.0* -- 0.1 0.2 -- 0.7 12.1 33.8 -- 0.7 1.2848
3 1.4 -- -- 6.4 45.9* 0.9* 0.5* -- 0.2 -- -- 1.4 1.4 41.5 -- 0.2 0.2436
B 2.5 -- -- 11.6 81.7* -- 0.8* -- -- -- -- 2.5 0.4 -- -- 0.4 --241
A -- -- -- -- 7.5 10.0 -- -- -- -- -- -- 12.5 70.0 -- -- --40
C -- -- -- 2.0 98.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 -- -- -- -- 98.7 -- -- 0.6155
M 0.3 -- 4.2 1.6 18.0 0.6 4.8* -- -- 0.6 -- -- 31.2 34.1* -- 1.6* 2.9311
 

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