23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2091


Base Pair (2091:2228)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.5 8.0 4.1 0.2 0.5* 29.4* 0.2* -- 0.4 2.0 2.2* 0.9 0.1 0.1 3.5 15.7 30.7846
3 1.8 15.1 3.0 -- 0.5* 36.2* -- -- -- 3.7 4.3* 0.9 -- 0.2 6.4 26.3 1.6437
B 3.3* 18.3 1.7 -- -- 56.8* -- -- -- 5.8* 2.5 0.4 -- -- -- 11.2 --241
A -- 7.3 7.3 -- -- 36.6* -- -- -- 4.9 17.1* -- -- -- 9.8 17.1 --41
C -- 1.0 6.0 -- -- 80.0* 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- 12.0 --100
E -- 12.3* 3.9 -- 1.3 3.9 -- -- -- -- 3.9 1.9 -- 0.6 15.5 52.3* 4.5155
M 1.6* 0.3 5.2* 0.6 0.6 3.6 0.3 -- 1.0* 0.3 -- 1.3* 0.3 -- 0.6 1.9 82.2309
 
Base Pair (2092:2227)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 0.6* 58.7* 0.2* -- 0.2 0.9 -- 0.5 -- -- 0.6 2.4 0.1 3.5 0.6 31.6846
3 -- -- 88.1* 0.5 -- -- 0.7 -- 0.2* -- -- 0.7* 4.3 -- 5.0 0.2 0.2437
B -- -- 85.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 5.4 -- 8.7 -- --241
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- -- 90.0* -- -- 2.0 2.0 -- 2.0* -- -- -- 1.0 -- 3.0 -- --100
E -- -- 88.4* 1.3 -- -- 1.9 -- 0.6* -- -- 1.9* 3.9 -- 0.6 0.6 0.6155
M -- 1.6* 7.1* -- -- -- 1.0 -- 0.3 -- -- 0.6 -- 0.3 1.6 1.3 85.9309
 

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