23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2130
| Base Pair (2130:2158)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8* |
1.2* |
28.9* |
0.5* |
0.2 |
0.4 |
5.0 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
11.6 |
0.5 |
-- |
-- |
49.3 | 847 |
| 3 |
3.2* |
2.3* |
45.5* |
0.7* |
0.2 |
0.5 |
7.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.7 |
0.2 |
11.7 |
-- |
-- |
-- |
27.4 | 437 |
| B |
-- |
-- |
81.3 |
-- |
-- |
-- |
9.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
2.4 |
19.5 |
-- |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
68.3* |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
39.6 |
-- |
-- |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
44.6 |
-- |
-- |
-- |
5.0 | 101 |
| E |
9.0* |
6.5* |
-- |
1.9* |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
77.3 | 155 |
| M |
0.3 |
-- |
1.9* |
0.3* |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.3* |
-- |
-- |
94.8 | 309 |
| |
| Base Pair (2131:2157)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
1.5 |
0.1 |
0.5* |
-- |
27.3* |
0.1 |
0.1 |
10.0 |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
6.4 |
0.4 |
0.5 |
52.3 | 846 |
| 3 |
-- |
2.8 |
-- |
0.7* |
-- |
42.7* |
-- |
-- |
8.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.2 |
0.7 |
0.5 |
32.8 | 436 |
| B |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
65.1 |
-- |
-- |
13.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.1 |
-- |
0.4 |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
70.0 |
-- |
-- |
12.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.5 |
7.5 |
2.5 |
-- | 40 |
| C |
-- |
1.0 |
-- |
1.0 |
-- |
44.6 |
-- |
1.0 |
45.5* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
2.0 | 101 |
| E |
-- |
5.2* |
-- |
1.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
92.2 | 155 |
| M |
1.6* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.6* |
96.4 | 309 |
| |
| Base Pair (2132:2156)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
3.7 |
2.5 |
1.1 |
0.2 |
21.5* |
-- |
1.2* |
5.2 |
0.2 |
0.1 |
0.6* |
-- |
5.2 |
0.9 |
3.9 |
53.7 | 847 |
| 3 |
-- |
6.9 |
-- |
0.7 |
0.5 |
33.0* |
-- |
-- |
8.5 |
0.2 |
0.2 |
0.9* |
-- |
10.1 |
1.4 |
3.0 |
34.8 | 437 |
| B |
-- |
3.7 |
-- |
0.4 |
0.4 |
55.6* |
-- |
-- |
15.4 |
0.4 |
-- |
1.2* |
-- |
17.4 |
-- |
5.4 |
-- | 241 |
| A |
-- |
43.9* |
-- |
-- |
-- |
24.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
2.4 |
-- |
4.9 |
14.6* |
-- |
7.3 | 41 |
| C |
-- |
-- |
15.8 |
5.9 |
-- |
36.6* |
-- |
9.9* |
6.9 |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
16.8 |
5.0 | 101 |
| E |
-- |
1.9* |
-- |
1.3* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 155 |
| M |
-- |
0.3 |
1.6* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
96.4 | 309 |
| |
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