23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2323
| Base Pair (2323:2334)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.7 | -- |
-- | 0.4 |
20.5* | -- |
8.3* | 0.1 | -- | 3.1 |
-- | -- | 19.2 | 7.1 |
0.4* | 0.9 | 31.3 | 848 |
| 3 |
16.9 | -- |
-- | 0.2 |
30.7* | -- |
15.3* | 0.2 | -- | 5.5 |
-- | -- | 26.1 | 4.1 |
-- | 0.9 | -- | 437 |
| B |
29.9 | -- |
-- | -- |
53.1 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 10.0 | 7.1 |
-- | -- | -- | 241 |
| A |
-- | -- |
-- | -- |
12.2 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 87.8 | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
-- | -- |
19.6 | -- |
2.0* | -- | -- | -- |
-- | -- | 37.3 | 39.2* |
-- | -- | 2.0 | 102 |
| E |
1.3* | -- |
-- | 0.6 |
0.6 | -- |
43.2* | 0.6 | -- | 15.5 |
-- | -- | 34.8 | 0.6 |
-- | 2.6* | -- | 155 |
| M |
-- | -- |
-- | 0.6 |
6.5* | -- |
0.3 | -- | -- | 0.6* |
-- | -- | 3.6 | 0.6 |
1.0* | 1.3 | 85.4 | 309 |
| |
| Base Pair (2324:2333)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 0.4 |
45.9* | 0.1 |
-- | 0.6 |
-- | -- | -- | 20.0 |
-- | 0.6* | 0.6 | -- |
-- | 0.6 | 31.2 | 848 |
| 3 |
-- | 0.2* |
62.5* | -- |
-- | 0.5 |
-- | -- | -- | 35.5 |
-- | -- | 1.1 | -- |
-- | -- | 0.2 | 437 |
| B |
-- | -- |
92.1 | -- |
-- | 0.8 |
-- | -- | -- | 7.1 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 241 |
| A |
-- | -- |
78.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 14.6 |
-- | -- | 7.3 | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | -- |
97.1 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 2.0 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.0 | 102 |
| E |
-- | 0.6 |
12.3 | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | 85.2 |
-- | -- | 1.3 | -- |
-- | -- | 0.6 | 155 |
| M |
-- | 0.6 |
5.5* | 0.3 |
-- | 1.0 |
-- | -- | -- | 4.2 |
-- | 1.6* | -- | -- |
-- | 1.6 | 85.1 | 309 |
| |
| Base Pair (2325:2332)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
37.5* | -- |
-- | 12.1* |
6.0 | 0.1* |
0.7 | 7.8 | 2.9 | -- |
-- | -- | 0.1 | -- |
0.9 | 0.1 | 31.6 | 848 |
| 3 |
51.0* | -- |
-- | 21.7* |
7.6 | -- |
0.9 | 12.8 | 5.5 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 0.5 | 437 |
| B |
75.5* | -- |
-- | 4.1* |
13.7 | -- |
-- | 6.6 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 241 |
| A |
100.0 | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
84.3* | -- |
-- | 2.9* |
7.8 | -- |
-- | 4.9 | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 102 |
| E |
-- | -- |
-- | 54.8 |
-- | -- |
2.6 | 25.8 | 15.5 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 1.3 | 155 |
| M |
2.9 | -- |
-- | 1.6 |
3.2* | 0.3 |
0.6* | 1.6 | 0.3 | -- |
-- | -- | 0.3 | -- |
2.6* | 0.3 | 86.1 | 309 |
| |
| Base Pair (2326:2331)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1 | 22.1 |
0.6 | -- |
-- | 28.7* |
0.5* | -- | 12.9 | -- |
0.4* | 0.1 | -- | 3.2 |
0.1 | -- | 31.5 | 848 |
| 3 |
0.2* | 33.4* |
0.7* | -- |
-- | 33.4 |
-- | -- | 24.9 | -- |
0.7 | -- | -- | 6.2 |
0.2 | -- | 0.2 | 437 |
| B |
-- | 45.9 |
-- | -- |
-- | 53.3 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 0.8 | 242 |
| A |
-- | 75.6 |
-- | -- |
-- | 17.1 |
-- | -- | -- | -- |
7.3 | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 41 |
| C |
-- | 31.4 |
2.0 | -- |
-- | 66.7 |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 102 |
| E |
0.6* | 2.6 |
1.9* | -- |
-- | 6.5 |
-- | -- | 70.3* | -- |
-- | -- | -- | 17.4 |
0.6 | -- | -- | 155 |
| M |
-- | 2.9 |
-- | -- |
-- | 9.4* |
1.3* | -- | -- | -- |
-- | 0.3* | -- | -- |
-- | -- | 86.1 | 309 |
| |
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