23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2402
| Base Pair (2402:2414)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.7* |
5.8 |
1.1 |
0.4 |
-- |
20.6* |
1.4* |
0.2 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
6.4 |
0.1 |
0.2 |
54.7 | 848 |
| 3 |
7.1* |
9.4 |
-- |
-- |
-- |
33.6* |
0.2* |
0.5 |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
45.0 | 438 |
| B |
12.8* |
16.9 |
-- |
-- |
-- |
60.7* |
0.4* |
0.8 |
6.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
0.8 | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 41 |
| C |
-- |
2.0 |
2.0* |
-- |
-- |
20.8 |
1.0 |
-- |
26.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
47.5* |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
99.3 | 155 |
| M |
-- |
1.9 |
2.3 |
1.0 |
-- |
2.3* |
3.2* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
0.3 |
86.0 | 309 |
| |
| Base Pair (2403:2413)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
39.0* |
11.8* |
0.2 |
1.2* |
0.4 |
0.6 |
-- |
0.2 |
5.7 |
0.6 |
1.4 |
0.5 |
3.2 |
2.5 |
1.7 |
31.1 | 848 |
| 3 |
-- |
53.4* |
20.1* |
-- |
2.3* |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
5.9 |
1.1 |
2.3 |
0.9 |
6.2 |
4.8 |
1.4 |
0.2 | 438 |
| B |
-- |
81.0* |
0.4* |
-- |
4.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.8 |
2.5 |
-- |
10.3 |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
-- |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
88.1* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6 |
56.1* |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 |
-- |
-- |
16.1 |
1.9 |
2.6* |
2.6 |
-- |
13.5 |
3.9 |
-- | 155 |
| M |
-- |
2.6 |
3.2 |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6* |
3.9* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
2.6* |
85.1 | 309 |
| |
| Base Pair (2404:2412)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.5 |
3.1 |
13.8 |
0.9 |
1.5* |
9.6* |
4.0 |
0.1* |
0.1 |
27.8* |
0.2 |
0.5 |
0.5 |
1.1 |
1.3 |
3.5 |
31.5 | 848 |
| 3 |
0.9 |
5.9 |
19.6 |
1.6 |
3.0* |
18.5* |
5.0 |
-- |
-- |
32.6* |
-- |
0.9 |
0.9 |
2.1 |
2.5 |
6.2 |
0.2 | 438 |
| B |
-- |
-- |
32.6 |
-- |
-- |
-- |
7.4 |
-- |
-- |
57.4 |
-- |
1.7 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
61.0* |
-- |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6* |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
13.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 101 |
| E |
2.6 |
0.6 |
4.5 |
4.5 |
8.4* |
47.7* |
2.6* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.3 |
5.8 |
3.2 |
17.4 |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
-- |
5.5* |
0.3* |
-- |
-- |
3.9 |
0.3 |
0.3 |
2.3 |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
85.6 | 309 |
| |
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