23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2506


Base Pair (2506:2582)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 27.6 -- -- 72.1 -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- --778
3 -- -- -- -- -- 99.5 -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- -- --418
B -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --242
A -- -- -- -- -- 95.1 -- -- 4.9 -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --97
E -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --135
M -- -- 81.7 -- -- 18.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --263
 
Base Pair (2507:2581)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 72.1* 0.1 -- -- 26.9 -- -- -- 0.1 0.1 -- -- -- -- 0.6* --778
3 -- 99.8 -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- --418
B -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --242
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- 99.0 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 -- -- -- -- -- --97
E -- 99.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- --135
M -- 18.3 0.4 -- -- 79.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 --263
 

Base Pair (2512:2576)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 90.8* -- -- -- 6.8 -- -- 0.1 0.4 0.3 -- -- 0.1 -- 1.2* 0.4780
3 -- 97.6 -- -- -- 0.7 -- -- -- 0.2 0.5 -- -- 0.2 -- -- 0.7418
B -- 98.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 1.2242
A -- 90.2 -- -- -- 7.3 -- -- -- -- -- -- -- 2.4 -- -- --41
C -- 87.8 -- -- -- 10.2 -- -- -- 2.0 -- -- -- -- -- -- --98
E -- 98.5 -- -- -- -- -- -- -- -- 1.5 -- -- -- -- -- --135
M -- 81.1* -- -- -- 15.2 -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 3.4* --264
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)