23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2518
| Base Pair (2518:2546)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.4* |
1.0* |
92.9* |
1.0 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.4 |
-- |
1.6 |
0.1 |
-- |
0.1 |
1.5 |
0.5 | 818 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
87.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
12.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
1.0* |
2.7* |
84.9* |
2.7 |
0.3 |
1.0 |
-- |
0.3 |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
4.0 |
1.3 | 298 |
| |
| Base Pair (2519:2545)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
4.7 |
0.4 |
1.9* |
-- |
82.7* |
0.2 |
-- |
6.6 |
0.1* |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
1.3 |
1.2 | 822 |
| 3 |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
95.2 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
-- |
78.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
54.9 |
-- |
-- |
41.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
94.1 |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
9.3 |
1.0 |
5.3* |
-- |
74.8* |
0.7 |
-- |
1.7 |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
3.2 | 302 |
| |
| Base Pair (2520:2544)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
77.6* |
0.2* |
2.8* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.1 |
1.3 |
6.3 |
9.6 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
1.0 | 823 |
| 3 |
-- |
68.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
12.4 |
18.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
38.5 |
57.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
83.8* |
0.7* |
7.6* |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
0.3 |
2.0 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.7 |
2.6 | 303 |
| |
| Base Pair (2521:2543)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
66.7* |
1.2* |
1.3* |
-- |
2.1 |
0.7 |
-- |
15.4 |
7.3 |
0.1 |
3.0 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
1.3 | 823 |
| 3 |
-- |
67.9* |
-- |
0.2* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
30.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
2.2 |
-- |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
93.3* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
54.8* |
3.3* |
3.3* |
-- |
4.0 |
2.0 |
-- |
0.3 |
19.1 |
0.3 |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
3.6 | 303 |
| |
|
| Base Pair (2522:2541)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.4* |
86.8* |
1.0* |
0.1 |
0.5 |
1.8 |
-- |
0.5 |
6.8 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.6 | 823 |
| 3 |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 418 |
| B |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 135 |
| M |
-- |
1.0* |
66.0* |
2.6* |
0.3 |
1.3 |
4.3 |
-- |
1.3 |
17.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
4.3 | 303 |
| |
|
| Base Pair (2529:2534)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.2 |
-- |
0.4 |
0.2* |
3.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
60.0* |
0.7 |
0.1* |
-- |
1.7 | 825 |
| 3 |
26.1 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
69.8 |
1.2 |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
44.9 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
53.5 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 243 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
5.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.5 |
2.9 |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
53.0* |
-- |
1.0* |
0.7* |
3.0 |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
36.1 |
0.3 |
0.3 |
-- |
4.9 | 302 |
| |
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