23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2733
| Base Pair (2733:2769)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9 |
7.1* |
2.1* |
12.4 |
0.9* |
1.3 |
6.4 |
21.9* |
1.6 |
2.4 |
0.6 |
0.6 |
0.3 |
0.4 |
0.4 |
1.6 |
39.0 | 675 |
| 3 |
0.8 |
1.1* |
0.3* |
16.9 |
1.6* |
0.3 |
5.0 |
27.2* |
1.1 |
0.3 |
1.1 |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
1.1 |
42.4 | 379 |
| B |
1.4 |
0.5 |
0.5 |
30.0 |
2.8* |
0.5* |
8.9 |
48.4* |
1.9 |
0.5* |
1.9 |
-- |
-- |
0.9 |
0.9 |
0.5 |
0.5 | 213 |
| A |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3* |
85.4 | 41 |
| C |
3.4 |
-- |
3.4* |
5.2 |
-- |
1.7 |
20.7 |
58.6* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
1.7 |
-- | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 125 |
| M |
0.4* |
18.9* |
4.6* |
7.1* |
-- |
2.9 |
5.0 |
4.6 |
2.1 |
6.7 |
-- |
1.7 |
-- |
0.4 |
0.4 |
2.5 |
42.3 | 238 |
| |
| Base Pair (2734:2768)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.8 |
6.2* |
0.7 |
10.1 |
1.3 |
0.7 |
1.3 |
13.2* |
0.7 |
0.9 |
11.0 |
1.3 |
-- |
0.4 |
2.7 |
3.1* |
40.5 | 675 |
| 3 |
4.0 |
0.3 |
0.3 |
14.2 |
1.1 |
0.3 |
0.3 |
20.6* |
1.3 |
0.3* |
18.7 |
-- |
-- |
0.5* |
2.6 |
2.9* |
32.7 | 379 |
| B |
1.9 |
0.5 |
0.5 |
24.4 |
-- |
-- |
0.5 |
31.9* |
2.3 |
0.5* |
30.0 |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
4.7* |
-- | 213 |
| A |
26.8* |
-- |
-- |
4.9* |
9.8 |
2.4* |
-- |
24.4 |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
4.9 |
9.8 |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.8 | 58 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
99.2 | 125 |
| M |
-- |
17.2* |
1.7 |
5.0* |
0.4 |
1.3 |
2.5 |
2.1 |
-- |
2.1 |
0.4 |
3.8 |
-- |
0.4 |
3.4* |
4.2 |
55.5 | 238 |
| |
| Base Pair (2735:2767)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.4* |
2.8 |
1.5 |
2.4* |
1.0 |
1.0* |
1.5 |
10.4 |
0.9 |
5.5* |
6.2 |
0.1 |
-- |
1.2 |
16.9 |
1.3 |
15.7 | 675 |
| 3 |
52.8* |
-- |
-- |
1.1* |
0.5 |
-- |
0.5 |
13.7 |
-- |
-- |
7.4 |
-- |
-- |
0.5 |
23.5 |
-- |
-- | 379 |
| B |
69.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.7 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.9 |
8.5 |
-- |
-- | 213 |
| A |
70.7* |
-- |
-- |
7.3* |
2.4 |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
58.6* |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
5.2* |
12.1 |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
17.2 |
-- |
1.7 | 58 |
| E |
19.2 |
-- |
-- |
0.8 |
0.8* |
-- |
1.6* |
6.4 |
-- |
-- |
14.4 |
-- |
-- |
-- |
56.8* |
-- |
-- | 125 |
| M |
1.7* |
8.0 |
4.2 |
5.0* |
2.1 |
3.4* |
2.1 |
2.1 |
2.5 |
16.0* |
0.8 |
0.4 |
-- |
2.5 |
1.7 |
2.9 |
44.6 | 238 |
| |
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