23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 2813


Base Pair (2813:2833)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 1.2 0.2 3.6 6.3 11.6 0.7 1.5 0.7* 0.5 3.8* 1.5 11.9 2.4 1.4* 3.1 26.1* 23.5586
3 1.9* 0.3 2.1 7.7 17.3 -- 0.3 0.3 0.5* 4.3* 2.1 17.6 3.7 1.9 4.0 31.6* 4.6376
B 3.3 -- 1.4 12.7 21.7* -- -- -- 0.9* 6.1* 2.8 19.8 6.6 -- 1.4* 20.3 2.8212
A -- -- -- 5.1 46.2* -- -- 2.6 -- -- 5.1 23.1 -- -- 10.3* 7.7 --39
C -- -- 20.0 -- -- -- 3.6 -- -- 10.9* 1.8 5.5 -- -- 3.6 54.5* --55
E -- 0.8 4.0 -- 0.8 -- 0.8 -- -- 2.4* -- 12.0 -- 5.6* 6.4 58.4* 8.8125
M -- -- 1.3 5.2* 1.9 2.6* 3.9 1.9 0.6 -- -- 0.6 -- 0.6 0.6 2.6 77.9155
 
Base Pair (2814:2832)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2* 0.9 0.5 7.5 0.8 -- 0.9* 0.5 -- 9.4 1.9 36.9* -- -- -- 14.0 26.5636
3 0.3 1.6 0.3* 8.5 1.1 -- -- 0.5* -- 15.7 2.9 48.9* -- -- -- 19.4 0.9376
B -- -- -- 11.3 -- -- -- -- -- -- -- 58.0 -- -- -- 30.7 --212
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 84.6 -- -- -- 15.4 --39
C -- -- -- 7.3 -- -- -- -- -- -- 1.8 83.6 -- -- -- 7.3 --55
E 0.8* 4.8 0.8 6.4* 3.2 -- -- 1.6 -- 47.2* 8.8 22.4 -- -- -- 1.6 2.4125
M -- -- 1.0* 5.9* 0.5 -- 2.9 0.5 -- 0.5 -- 2.4 -- -- -- 5.9 80.4205
 

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