23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 29


Base Pair (29:476)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 8.7 0.7 0.6* -- 67.3* 0.1 0.3 10.6 0.1 -- -- 0.4* 3.1 0.1 1.6 6.1678
3 -- -- 0.5 -- -- 93.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.5 3.3403
B -- -- 0.8 -- -- 99.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --251
A -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- -- -- -- -- 65.2* -- -- -- -- -- -- 6.5* 28.3 -- -- --46
E -- -- -- -- -- 79.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 8.6 12.2116
M -- 25.8 1.3* 1.7 -- 21.4 0.4 0.9 31.4* 0.4 -- -- -- 3.5 0.4 0.4 12.2229
 
Base Pair (30:475)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 10.5 -- 0.1* 26.3 39.7* -- 0.1 0.1 0.4* -- 0.1* 11.8 0.3 0.1 -- 4.7 5.5678
3 17.6 -- -- 6.5 58.8 -- -- -- -- -- -- 11.7 0.2 0.2 -- 1.7 3.1403
B 28.4 -- -- 1.2 69.6 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.4 -- -- --250
A -- -- -- 8.3 75.0 -- -- -- -- -- -- 2.8 -- -- -- 13.9 --36
C -- -- -- 87.0 6.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 6.5 --46
E -- -- -- 17.1 30.8 -- -- -- -- -- -- 39.3 -- -- -- 1.7 11.2117
M -- -- 0.4* 48.9* 12.7 -- 0.4 0.4 1.3 -- 0.4* 14.4 0.4 -- -- 9.6 10.8229
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)