23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 34
| Base Pair (34:446)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- | 8.8 |
0.6 | 9.3 |
-- | 40.9* |
11.5* | 1.8 | 17.2 | 0.1 |
0.1 | 0.1* | 0.1 | 1.5 |
-- | 4.9 | 2.8 | 679 |
| 3 |
-- | 15.0 |
-- | -- |
-- | 65.1* |
-- | -- | 9.7 | 0.2* |
-- | -- | -- | 1.2 |
-- | 8.0 | 0.7 | 401 |
| B |
-- | 1.2 |
-- | -- |
-- | 74.8 |
-- | -- | 9.2 | -- |
-- | -- | -- | 1.2 |
-- | 12.8 | 0.8 | 250 |
| A |
-- | 80.6 |
-- | -- |
-- | 13.9 |
-- | -- | 5.6 | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | 36 |
| C |
-- | -- |
-- | -- |
-- | 17.4 |
2.2 | -- | 78.3* | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | 2.2* | -- | 46 |
| E |
-- | 24.3 |
-- | -- |
-- | 60.0* |
-- | -- | 12.2 | 0.9* |
-- | -- | -- | 1.7 |
-- | -- | 0.9 | 115 |
| M |
-- | -- |
1.7 | 27.2 |
-- | 3.9* |
33.2* | 5.2 | 18.1 | -- |
0.4 | 0.4* | 0.4 | 2.2 |
-- | -- | 7.4 | 232 |
| |
|
| Base Pair (43:435)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
26.1* | 9.5* |
1.3 | 1.0 |
0.8 | 0.6 |
3.5* | 2.0 | 1.5 | 6.4 |
3.9 | 0.7 | 5.3 | 0.3 |
0.8 | 0.1* | 36.1 | 714 |
| 3 |
28.6* | 16.9* |
2.2 | -- |
1.2 | 1.0 |
5.0* | 2.7 | 2.5 | 11.4 |
7.0 | 1.2 | 7.5 | 0.5 |
1.2 | 0.2* | 10.4 | 402 |
| B |
46.0* | -- |
0.8 | -- |
2.0 | -- |
8.0 | 4.4 | -- | 16.8* |
10.4 | -- | 9.6 | -- |
0.8 | -- | 1.2 | 250 |
| A |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | -- | -- |
-- | -- | 100.0 | 36 |
| C |
83.5* | -- |
-- | 5.1* |
-- | -- |
-- | 2.5 | -- | -- |
-- | -- | 3.8 | -- |
-- | -- | 5.1 | 79 |
| E |
-- | 58.6* |
6.0* | -- |
-- | 3.4 |
-- | -- | 8.6 | 3.4 |
1.7 | 4.3 | 5.2 | 1.7 |
2.6 | 0.9 | 3.6 | 116 |
| M |
2.1* | -- |
-- | 1.3 |
0.4 | -- |
2.1* | 0.4 | 0.4 | -- |
-- | -- | 2.1 | -- |
0.4 | -- | 90.6 | 233 |
| |
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