23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 370
Base Pair (370:435)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
25.2* |
-- |
0.2 |
0.3 |
4.8 |
0.2* |
0.8* |
5.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
15.6 |
17.8 |
-- |
0.1 |
28.8 | 893 |
3 |
26.2 |
-- |
-- |
-- |
7.4 |
0.4 |
0.6 |
8.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.3 |
29.4* |
-- |
-- |
3.4 | 538 |
B |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
0.7* |
16.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
34.9 |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 281 |
A |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
56.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
27.0 | 37 |
C |
83.0* |
-- |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- |
2.0* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
4.0 | 100 |
E |
4.1 |
-- |
-- |
-- |
6.4 |
0.9 |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.6 |
71.8* |
-- |
-- |
2.7 | 220 |
M |
0.4 |
-- |
0.8 |
0.4* |
0.4 |
-- |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
1.6* |
-- |
2.0* |
0.4 |
-- |
0.4 |
92.2 | 255 |
|
Base Pair (371:434)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
0.1* |
-- |
55.9* |
0.1 |
-- |
6.2 |
4.6 |
8.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.1 | 893 |
3 |
-- |
0.2* |
-- |
71.7* |
-- |
-- |
7.4 |
6.9 |
12.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 538 |
B |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 280 |
A |
-- |
2.7 |
-- |
10.8 |
-- |
-- |
10.8 |
5.4 |
70.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
E |
-- |
-- |
-- |
47.1 |
-- |
-- |
16.3 |
15.4 |
19.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3 | 221 |
M |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
0.4* |
-- |
5.9* |
1.6 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.5 | 255 |
|
Base Pair (372:433)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
51.9* |
-- |
-- |
0.1* |
14.7 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
2.6 |
-- |
0.1 |
26.5 | 894 |
3 |
69.9 |
-- |
-- |
-- |
18.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.1 |
3.7 |
-- |
-- |
3.7 | 539 |
B |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 281 |
A |
83.8 |
-- |
-- |
-- |
13.5 |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
85.0 |
-- |
-- |
-- |
14.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
E |
32.6 |
-- |
-- |
-- |
39.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 |
8.6 |
-- |
-- |
9.0 | 221 |
M |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
7.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
1.2 |
-- |
0.4 |
85.1 | 255 |
|
Base Pair (373:432)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
74.8 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
24.5 | 894 |
3 |
-- |
-- |
99.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 539 |
B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
E |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 221 |
M |
-- |
-- |
12.9 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
85.9 | 255 |
|
Base Pair (374:431)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
-- |
52.9* |
-- |
0.1* |
1.0 |
1.7 |
0.1 |
-- |
0.4* |
19.0 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
24.4 | 894 |
3 |
-- |
-- |
-- |
64.6* |
-- |
0.2* |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
0.7* |
31.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 539 |
B |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
A |
-- |
-- |
-- |
70.3 |
-- |
-- |
-- |
29.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
C |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 | 100 |
E |
-- |
-- |
-- |
19.0 |
-- |
0.5* |
-- |
1.4* |
-- |
-- |
1.8 |
76.9* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 221 |
M |
-- |
-- |
-- |
10.6 |
-- |
-- |
3.5 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.5 | 255 |
|
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