23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 525
| Base Pair (525:572)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
48.9 |
-- |
-- |
-- |
5.1 |
-- |
-- |
14.4 |
-- |
-- |
28.1 |
-- |
-- |
0.3 |
3.2 | 877 |
| 3 |
-- |
-- |
57.6 |
-- |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
35.3 |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 | 521 |
| B |
-- |
-- |
96.8 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- | 278 |
| A |
-- |
-- |
40.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
54.1 |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
30.0 |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
11.0 |
-- |
-- |
54.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
7.8 |
-- |
-- |
-- |
10.2 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
79.6 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 206 |
| M |
-- |
-- |
38.7 |
-- |
-- |
-- |
6.6 |
-- |
-- |
41.0 |
-- |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
10.5 | 256 |
| |
| Base Pair (526:571)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
-- |
2.8 |
21.5 |
-- |
-- |
19.5 |
27.9* |
0.1 |
1.6 |
1.7 |
0.3 |
18.8* |
-- |
1.6 |
1.1* |
2.8 | 879 |
| 3 |
-- |
-- |
2.7 |
31.5* |
-- |
-- |
18.0 |
14.9 |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
31.4* |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 523 |
| B |
-- |
-- |
-- |
59.1 |
-- |
-- |
12.9 |
28.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 279 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.3 |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
10.0 |
-- |
-- |
-- |
77.0 |
-- |
-- |
12.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
6.8 |
-- |
-- |
-- |
10.6 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
79.2 |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 207 |
| M |
0.8 |
-- |
0.4 |
9.4 |
-- |
-- |
-- |
65.2* |
-- |
-- |
5.9 |
1.2 |
-- |
-- |
5.5 |
3.9* |
7.8 | 256 |
| |
| Base Pair (527:570)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
45.7 |
-- |
-- |
-- |
13.8 |
-- |
-- |
19.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.6 |
-- |
-- |
2.1 | 882 |
| 3 |
-- |
55.5 |
-- |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.5 |
-- |
-- |
0.6 | 526 |
| B |
-- |
88.7 |
-- |
-- |
-- |
11.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
-- |
45.9 |
-- |
-- |
-- |
54.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
12.1 |
-- |
-- |
-- |
18.4 |
-- |
-- |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
64.7 |
-- |
-- |
1.4 | 207 |
| M |
-- |
4.7 |
-- |
-- |
-- |
12.1 |
-- |
-- |
65.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.7 |
-- |
-- |
5.8 | 256 |
| |
| Base Pair (528:569)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3 |
-- |
-- |
64.0* |
0.6 |
-- |
0.3 |
0.9 |
0.2 |
0.1 |
0.5* |
5.8 |
-- |
-- |
0.1 |
2.7 |
24.4 | 881 |
| 3 |
0.6* |
-- |
-- |
57.5* |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
38.3 | 525 |
| B |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
8.1* |
-- |
-- |
62.2* |
2.7 |
-- |
8.1 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
13.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
99.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.1 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
64.1* |
0.8 |
-- |
-- |
2.3 |
0.4 |
0.4 |
1.6* |
16.0 |
-- |
-- |
0.4 |
9.0 |
5.1 | 256 |
| |
| Base Pair (529:568)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2 |
-- |
-- |
67.5* |
2.7 |
-- |
-- |
0.8 |
1.2 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
0.1* |
0.2* |
2.3 |
23.5 | 882 |
| 3 |
0.4 |
-- |
-- |
55.1* |
3.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.4* |
2.3 |
35.9 | 526 |
| B |
-- |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 | 282 |
| A |
5.4 |
-- |
-- |
8.1 |
51.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
16.2 |
-- |
-- |
5.4* |
13.5 |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
4.3 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
90.3 | 207 |
| M |
-- |
-- |
-- |
81.2* |
1.6 |
-- |
-- |
2.7 |
4.3 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4* |
-- |
3.1 |
5.9 | 256 |
| |
| Base Pair (530:567)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.0 |
0.3* |
-- |
11.4 |
40.0* |
0.1 |
-- |
23.3* |
1.5 |
-- |
0.7 |
2.6 |
1.0 |
9.4 |
0.6 |
5.6 |
2.4 | 879 |
| 3 |
1.5 |
-- |
-- |
8.6 |
35.8* |
-- |
-- |
39.2* |
0.2 |
-- |
1.1 |
3.4 |
0.6 |
0.8 |
1.0 |
6.3 |
1.5 | 523 |
| B |
1.1 |
-- |
-- |
12.2 |
67.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
6.1 |
1.1 |
1.4 |
-- |
11.1 |
-- | 279 |
| A |
8.1 |
-- |
-- |
27.0 |
-- |
-- |
-- |
35.1* |
2.7 |
-- |
13.5 |
2.7 |
-- |
-- |
5.4 |
5.4* |
-- | 37 |
| C |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
12.0 |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
79.0 |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
1.0 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
92.8 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
3.9 | 207 |
| M |
0.4 |
-- |
-- |
21.5 |
64.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
0.8 |
-- |
-- |
6.2 |
4.7 | 256 |
| |
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