23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 626
| Base Pair (626:642)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
7.4 |
0.8 |
8.6* |
2.8 |
11.2* |
0.2 |
0.1 |
6.5 |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
1.4 |
0.1 |
7.8 |
51.0 | 880 |
| 3 |
-- |
12.4 |
0.2 |
12.5* |
4.1 |
16.2* |
-- |
0.2 |
3.3 |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
0.8 |
0.2 |
8.5 |
38.9 | 518 |
| B |
-- |
21.8 |
0.4 |
23.2* |
6.4 |
26.1* |
-- |
0.4 |
5.4 |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
1.4 |
-- |
12.1 |
-- | 280 |
| A |
-- |
8.1 |
-- |
-- |
8.1 |
29.7* |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
18.9* |
-- |
-- |
2.7 |
27.0 |
-- | 37 |
| C |
-- |
1.0 |
4.0 |
7.0 |
4.0 |
12.0 |
-- |
-- |
40.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.0 |
-- |
23.0* |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 201 |
| M |
-- |
-- |
0.8 |
1.5* |
-- |
1.1* |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
94.3 | 262 |
| |
| Base Pair (627:641)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
41.5* |
-- |
-- |
0.2 |
5.8 |
-- |
-- |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
51.2 | 881 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
51.3* |
-- |
-- |
-- |
8.7 |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
39.4 | 519 |
| B |
-- |
-- |
-- |
85.8* |
-- |
-- |
-- |
12.8 |
-- |
-- |
1.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
-- |
-- |
-- |
67.6 |
-- |
-- |
-- |
24.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.1 | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
90.0* |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
1.0* |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 201 |
| M |
-- |
-- |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
0.8 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.0 | 262 |
| |
| Base Pair (628:640)
|
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
36.6* |
-- |
-- |
-- |
8.7 |
-- |
0.2* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.8 |
2.4 |
-- |
-- |
50.4 | 882 |
| 3 |
46.0 |
-- |
-- |
-- |
10.6 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
3.7 |
-- |
-- |
38.7 | 520 |
| B |
75.5 |
-- |
-- |
-- |
19.5 |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
70.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
27.0 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
81.0 |
-- |
-- |
-- |
14.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 201 |
| M |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
3.1* |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
0.8 |
-- |
-- |
93.6 | 262 |
| |
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