23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 995
Base Pair (995:1160)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.1 |
30.9* |
1.6* |
0.9 |
-- |
2.2 |
2.0 |
15.2* |
0.8 |
5.3 |
2.0 |
2.4 |
-- |
-- |
2.4 |
0.7 |
33.4 | 849 |
3 |
-- |
38.1* |
0.8* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
6.8 |
0.8 |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
49.2 | 473 |
B |
-- |
75.0* |
1.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
13.3 |
1.7 |
7.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 240 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 37 |
C |
-- |
82.0* |
-- |
-- |
-- |
8.0 |
3.0* |
-- |
-- |
6.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.9 | 196 |
M |
0.4 |
-- |
3.6* |
2.9 |
-- |
3.6 |
5.1 |
46.7* |
2.5 |
2.5 |
4.7 |
0.4* |
-- |
-- |
7.2 |
2.2 |
18.2 | 276 |
|
|
Base Pair (999:1156)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
55.5* |
0.8* |
-- |
4.3 |
0.8 |
-- |
0.1 |
0.4 |
0.5* |
0.5 |
0.2 |
-- |
10.0 |
22.2 |
4.7 | 847 |
3 |
-- |
-- |
51.4* |
0.2* |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
0.2 |
-- |
7.6 |
32.7 |
0.2 | 471 |
B |
-- |
-- |
97.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
75.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.0 |
-- | 36 |
C |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
E |
-- |
-- |
3.6 |
0.5 |
-- |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.5* |
-- |
0.5* |
-- |
15.5 |
74.7* |
0.5 | 194 |
M |
-- |
-- |
47.1* |
2.2* |
-- |
0.7 |
2.5 |
-- |
0.4 |
1.1 |
0.4* |
1.4 |
0.4 |
-- |
17.8 |
12.0 |
14.1 | 276 |
|
|
Base Pair (1001:1154)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.7 |
0.1 |
0.2 |
10.6 |
-- |
-- |
3.3 |
10.3 |
61.8* |
0.1 |
0.8 |
3.9* |
-- |
0.1 |
1.3* |
0.1 |
6.4 | 846 |
3 |
1.1 |
0.2 |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
10.0 |
70.2* |
-- |
1.5 |
7.0* |
-- |
0.2 |
2.3* |
-- |
0.4 | 470 |
B |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
2.6 |
-- |
-- |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
24.4 |
28.5* |
-- |
3.6 |
17.1* |
-- |
-- |
5.7* |
-- |
1.0 | 193 |
M |
0.4* |
-- |
0.7* |
20.7 |
-- |
-- |
10.1 |
14.5 |
33.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
19.2 | 276 |
|
|
Base Pair (1019:1143)
|
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
-- |
-- |
67.3 |
-- |
-- |
0.4 |
0.9 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
0.1 |
0.6 |
27.7 | 848 |
3 |
-- |
-- |
93.0 |
-- |
-- |
0.2 |
1.3 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 472 |
B |
-- |
-- |
98.3 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
-- |
97.2 |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
-- |
-- |
96.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
-- |
-- |
85.6 |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
7.2 |
-- |
-- |
-- |
3.1 | 195 |
M |
-- |
-- |
13.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
-- |
0.4 |
1.8 |
83.0 | 276 |
|
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