23S rRNA Lousy Base Pair Frequencies for Helical Element 995


Base Pair (995:1160)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 30.9* 1.6* 0.9 -- 2.2 2.0 15.2* 0.8 5.3 2.0 2.4 -- -- 2.4 0.7 33.4849
3 -- 38.1* 0.8* -- -- 0.2 -- -- -- 6.8 0.8 4.0 -- -- -- -- 49.2473
B -- 75.0* 1.7* -- -- 0.4 -- -- -- 13.3 1.7 7.9 -- -- -- -- --240
A -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.037
C -- 82.0* -- -- -- 8.0 3.0* -- -- 6.0 -- -- -- -- -- -- 1.0100
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.9196
M 0.4 -- 3.6* 2.9 -- 3.6 5.1 46.7* 2.5 2.5 4.7 0.4* -- -- 7.2 2.2 18.2276
 

Base Pair (999:1156)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 55.5* 0.8* -- 4.3 0.8 -- 0.1 0.4 0.5* 0.5 0.2 -- 10.0 22.2 4.7847
3 -- -- 51.4* 0.2* -- 7.0 -- -- -- -- 0.6* -- 0.2 -- 7.6 32.7 0.2471
B -- -- 97.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.5 -- --241
A -- -- -- -- -- 75.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 25.0 --36
C -- -- 98.0 -- -- 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --100
E -- -- 3.6 0.5 -- 3.1 -- -- -- -- 1.5* -- 0.5* -- 15.5 74.7* 0.5194
M -- -- 47.1* 2.2* -- 0.7 2.5 -- 0.4 1.1 0.4* 1.4 0.4 -- 17.8 12.0 14.1276
 

Base Pair (1001:1154)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.7 0.1 0.2 10.6 -- -- 3.3 10.3 61.8* 0.1 0.8 3.9* -- 0.1 1.3* 0.1 6.4846
3 1.1 0.2 -- 7.0 -- -- -- 10.0 70.2* -- 1.5 7.0* -- 0.2 2.3* -- 0.4470
B -- 0.4 -- -- -- -- -- -- 99.2 -- -- -- -- 0.4 -- -- --241
A -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- --100
E 2.6 -- -- 17.1 -- -- -- 24.4 28.5* -- 3.6 17.1* -- -- 5.7* -- 1.0193
M 0.4* -- 0.7* 20.7 -- -- 10.1 14.5 33.7* 0.4 -- -- -- -- -- 0.4 19.2276
 

Base Pair (1019:1143)  
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- -- 67.3 -- -- 0.4 0.9 -- -- 0.7 -- -- 2.2 -- 0.1 0.6 27.7848
3 -- -- 93.0 -- -- 0.2 1.3 -- -- 1.3 -- -- 3.0 -- -- -- 1.2472
B -- -- 98.3 -- -- -- 0.8 -- -- 0.8 -- -- -- -- -- -- --241
A -- -- 97.2 -- -- 2.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- -- 96.0 -- -- -- 2.0 -- -- -- -- -- 2.0 -- -- -- --100
E -- -- 85.6 -- -- -- 2.1 -- -- 2.1 -- -- 7.2 -- -- -- 3.1195
M -- -- 13.0 -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- 1.1 -- 0.4 1.8 83.0276
 

Last generated : Fri Jul 20 2001 (9 : 42)