23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1011
| Base Pair (1011:1150)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
19.8* |
7.0* |
5.3* |
36.0* |
0.4 |
3.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
28.0 | 848 |
| 3 |
34.1* |
12.5* |
7.0* |
39.4* |
0.2 |
5.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 472 |
| B |
52.3* |
0.4* |
12.4* |
34.0* |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
72.2* |
-- |
-- |
27.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
96.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- | 100 |
| E |
4.6* |
29.7* |
1.5* |
48.2* |
-- |
12.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.1 | 195 |
| M |
2.5* |
-- |
4.3* |
8.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
84.0 | 276 |
| |
|
| Base Pair (1013:1149)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
24.6* |
13.1* |
8.2* |
22.5* |
1.6 |
2.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
27.5 | 849 |
| 3 |
26.0* |
22.8* |
12.3* |
31.3* |
2.5 |
3.6 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 473 |
| B |
18.7* |
30.7* |
16.6* |
29.9* |
-- |
3.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
80.6* |
8.3* |
2.8* |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
78.0* |
-- |
-- |
20.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
25.0* |
15.8* |
8.7* |
38.8* |
6.1 |
3.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 | 196 |
| M |
2.9* |
1.1* |
4.3* |
8.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 276 |
| |
| Base Pair (1014:1148)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.7* |
17.7* |
20.4* |
19.5* |
0.7 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
27.1 | 847 |
| 3 |
10.0* |
31.8* |
34.0* |
18.9* |
0.2 |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
0.2 | 471 |
| B |
7.1* |
8.3* |
56.0* |
26.1* |
0.4 |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
77.8* |
22.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
46.0* |
-- |
2.0* |
47.0* |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- | 100 |
| E |
15.5* |
52.6* |
8.8* |
13.4* |
-- |
4.1 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.6 |
-- |
0.5 | 194 |
| M |
2.2* |
-- |
4.0* |
10.5* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 276 |
| |
| Base Pair (1015:1147)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
11.2* |
10.4* |
22.0* |
23.2* |
0.1 |
3.7 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
27.7 | 849 |
| 3 |
19.2* |
12.7* |
20.5* |
38.1* |
0.2 |
6.6 |
-- |
0.4 |
0.2 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.3 | 473 |
| B |
15.4* |
3.7* |
36.5* |
43.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 241 |
| A |
22.2* |
66.7* |
8.3* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
2.0* |
26.0* |
61.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
23.5* |
13.8 |
3.1 |
37.8* |
0.5 |
15.8* |
-- |
1.0 |
-- |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.1 | 196 |
| M |
0.7* |
0.7* |
10.5* |
5.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.9 | 276 |
| |
| Base Pair (1016:1146)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
16.4* |
30.4* |
17.9* |
6.9* |
0.5 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
27.3 | 849 |
| 3 |
28.3* |
40.8* |
21.4* |
8.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 473 |
| B |
29.0* |
19.5* |
36.1* |
14.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
88.9* |
-- |
5.6* |
5.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
2.0* |
61.0* |
26.0* |
7.0* |
2.0 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
16.3* |
74.5* |
6.1* |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 196 |
| M |
1.1* |
1.4* |
9.1* |
4.0* |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 276 |
| |
| Base Pair (1017:1145)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
51.1* |
1.2* |
1.8* |
15.4* |
2.8 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
27.2 | 849 |
| 3 |
81.8* |
1.7* |
1.9* |
12.1* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 | 473 |
| B |
78.8* |
3.3* |
3.7* |
11.2* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- | 241 |
| A |
77.8* |
-- |
-- |
19.4* |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
36.0* |
1.0* |
2.0* |
48.0* |
13.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
86.2* |
-- |
-- |
11.7* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 196 |
| M |
4.0* |
0.4* |
1.4* |
9.4* |
1.1 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
83.0 | 276 |
| |
| Base Pair (1018:1144)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.9* |
50.8* |
19.2* |
0.8* |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
27.2 | 848 |
| 3 |
1.3* |
69.1* |
28.2* |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 472 |
| B |
-- |
46.9* |
52.3* |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
77.8* |
19.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
91.0* |
7.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
3.1* |
94.9* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 195 |
| M |
0.7* |
5.1* |
8.3* |
1.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
82.9 | 276 |
| |
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