23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1087
| Base Pair (1087:1102) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
88.0* |
0.5* |
1.8* |
6.8* |
0.9 |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.8 | 867 |
| 3 |
94.7* |
0.8* |
-- |
3.9* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 491 |
| B |
98.4* |
0.8* |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 248 |
| A |
64.9* |
5.4* |
-- |
29.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
92.0* |
-- |
-- |
6.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
95.6* |
-- |
-- |
3.4* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 206 |
| M |
74.6* |
-- |
5.8* |
12.3* |
2.2 |
-- |
0.7 |
0.4 |
-- |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
2.3 | 276 |
| |
|
| Base Pair (1091:1100) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
93.2* |
0.1* |
1.9* |
1.8* |
0.5 |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.7 |
0.6 | 874 |
| 3 |
99.0* |
-- |
0.6* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 498 |
| B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 255 |
| A |
91.9* |
-- |
8.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
98.0* |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 206 |
| M |
81.2* |
0.4* |
4.3* |
5.8* |
1.1 |
-- |
1.1 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.4 |
0.4 |
-- |
-- |
2.2 |
1.5 | 276 |
| |
| Base Pair (1092:1099) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
70.1* |
26.9* |
0.5* |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.2 |
0.8 | 875 |
| 3 |
-- |
58.3* |
40.9* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 499 |
| B |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 256 |
| A |
-- |
94.6* |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
1.0* |
98.1* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 206 |
| M |
0.7* |
80.4* |
11.2* |
1.4* |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
1.1 |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.7 |
1.9 | 276 |
| |
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