23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 121
| Base Pair (121:130)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
51.1* |
0.9* |
0.1* |
11.2* |
5.4 |
-- |
0.7 |
0.8 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.4 | 753 |
| 3 |
85.7* |
-- |
-- |
0.7* |
7.9 |
-- |
0.2 |
1.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 420 |
| B |
94.7* |
-- |
-- |
0.4* |
3.0 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 264 |
| A |
38.9 |
-- |
-- |
5.6 |
52.8* |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
16.2* |
-- |
-- |
73.7* |
8.1 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
80.0* |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
3.3 |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.8 | 120 |
| M |
3.8* |
3.0* |
0.4* |
3.4* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.0 | 234 |
| |
| Base Pair (122:129)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
52.8* |
12.1* |
1.3* |
3.7* |
0.3 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
29.2 | 754 |
| 3 |
69.4* |
21.6* |
2.1* |
2.1* |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 421 |
| B |
97.4* |
-- |
-- |
1.9* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 265 |
| A |
91.7* |
-- |
-- |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
86.9* |
-- |
-- |
13.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
0.8* |
75.8* |
7.5* |
0.8* |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
11.6 | 120 |
| M |
8.5* |
-- |
0.4* |
2.6* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
87.6 | 234 |
| |
| Base Pair (123:128)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
53.8* |
0.3* |
0.4* |
1.7* |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
43.3 | 753 |
| 3 |
69.8* |
0.2* |
0.2* |
1.4* |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.8 | 420 |
| B |
97.0* |
-- |
-- |
2.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 264 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 99 |
| E |
0.8* |
0.8* |
0.8* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.6 | 120 |
| M |
6.4* |
0.4* |
0.9* |
2.1* |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
89.3 | 234 |
| |
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