23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1262
| Base Pair (1262:2017)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.7* |
0.9* |
13.2* |
61.3* |
0.5 |
0.4 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
1.1 | 802 |
| 3 |
40.5* |
1.6* |
0.9* |
54.3* |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- | 427 |
| B |
5.1* |
-- |
1.3* |
92.4* |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
63.4* |
17.1* |
-- |
17.1* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
90.0* |
-- |
0.7 |
4.7* |
-- |
2.0* |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- | 150 |
| M |
0.4* |
-- |
0.7* |
94.5* |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
3.2 | 275 |
| |
| Base Pair (1263:2016) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
21.4* |
-- |
0.4 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1* |
1.6 |
-- |
0.4 |
1.0 |
-- |
72.8* |
1.2 | 802 |
| 3 |
40.3* |
-- |
0.5 |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
1.9 |
-- |
55.0* |
-- | 427 |
| B |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- | 236 |
| A |
53.7* |
-- |
2.4* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
19.5 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- | 100 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
4.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
90.5* |
3.7 | 275 |
| |
|
| Base Pair (1269:2011)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
29.1* |
0.1* |
2.5* |
52.2* |
13.3 |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
1.4 | 802 |
| 3 |
50.8* |
-- |
-- |
26.0* |
22.2 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 427 |
| B |
28.8* |
-- |
-- |
36.4* |
33.9 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
22.0* |
-- |
-- |
48.8* |
29.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
8.0* |
-- |
-- |
91.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
93.3* |
-- |
-- |
3.3* |
2.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 150 |
| M |
2.9* |
0.4* |
7.3* |
78.9* |
4.0 |
-- |
0.7 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
4.0 | 275 |
| |
| Base Pair (1270:2010)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
86.3* |
5.9* |
2.7* |
-- |
1.6 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
1.4 | 802 |
| 3 |
0.2 |
98.1* |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 427 |
| B |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
2.4* |
92.7* |
-- |
2.4* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
1.5* |
63.3* |
16.7* |
7.6* |
-- |
3.3 |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
1.8 |
4.4 | 275 |
| |
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