23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1295
| Base Pair (1295:1645)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.0* |
50.7* |
20.2* |
0.7* |
3.6 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.8 |
-- |
0.1 |
2.8 |
0.6 |
-- |
0.5 |
6.3 | 833 |
| 3 |
22.8* |
61.9* |
0.7* |
1.1* |
6.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
4.8 |
1.1 |
-- |
0.9 |
0.2 | 457 |
| B |
3.5* |
95.0* |
-- |
1.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 260 |
| A |
17.1* |
82.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
56.4* |
1.3* |
1.9 |
0.6 |
18.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
14.1 |
3.2 |
-- |
2.6* |
0.6 | 156 |
| M |
1.4* |
15.2* |
59.1* |
0.4* |
0.4 |
1.4 |
0.4 |
-- |
0.4 |
2.5 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
18.6 | 276 |
| |
| Base Pair (1296:1644)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.2* |
19.2* |
3.1* |
19.4* |
6.3 |
10.9 |
0.1 |
0.2 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
5.9 | 826 |
| 3 |
53.8* |
1.6* |
-- |
32.4* |
11.3 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 450 |
| B |
69.6* |
2.0* |
-- |
27.3* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 253 |
| A |
90.2* |
-- |
-- |
4.9* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
18.6* |
1.3* |
-- |
48.1* |
29.5 |
0.6 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 156 |
| M |
11.6* |
20.7 |
7.6 |
5.1* |
0.4 |
32.2* |
0.4 |
-- |
-- |
4.0* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
17.5 | 276 |
| |
| Base Pair (1297:1643)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8* |
84.0* |
3.5* |
0.1* |
0.1 |
1.4 |
-- |
-- |
0.1 |
2.0 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
6.1 | 835 |
| 3 |
3.3* |
94.6* |
1.5* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 459 |
| B |
-- |
99.2* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
97.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
9.7* |
85.2* |
3.2* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 155 |
| M |
-- |
61.6* |
6.9* |
0.4* |
-- |
4.3 |
-- |
-- |
0.4 |
6.2 |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
18.2 | 276 |
| |
| Base Pair (1298:1642)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
62.2* |
16.9* |
0.5* |
-- |
7.5 |
0.6 |
-- |
-- |
1.0 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
10.5 | 836 |
| 3 |
-- |
82.6* |
9.6* |
0.9* |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 | 460 |
| B |
-- |
99.2* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
50.0* |
26.9* |
2.6* |
-- |
17.9 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 156 |
| M |
-- |
15.9* |
34.1* |
-- |
-- |
12.7 |
1.8 |
-- |
-- |
2.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
0.7 |
31.2 | 276 |
| |
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