23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1303
| Base Pair (1303:1625)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
66.0* |
0.2* |
0.7* |
24.0* |
1.0 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
1.2 |
0.2 |
0.1 |
5.6 | 840 |
| 3 |
81.9* |
-- |
1.1* |
15.9* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 464 |
| B |
69.8* |
-- |
1.1* |
27.5* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.0* |
1.0* |
-- |
95.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
96.9* |
-- |
1.2* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 161 |
| M |
61.6* |
0.4* |
0.4* |
12.0* |
1.4 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
0.4 |
0.7 |
3.6 |
0.7 |
0.4 |
17.2 | 276 |
| |
| Base Pair (1304:1624)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.2* |
47.0* |
10.7* |
11.8* |
0.6 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
5.5 | 841 |
| 3 |
41.9* |
26.7* |
9.9* |
20.4* |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 465 |
| B |
0.8* |
46.0* |
17.5* |
35.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
82.9* |
7.3* |
-- |
4.9* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
94.0* |
5.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 161 |
| M |
-- |
64.1* |
14.1* |
1.4* |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
17.1 | 276 |
| |
| Base Pair (1305:1623)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
13.3* |
42.9* |
3.3* |
29.0* |
4.8 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
5.6 | 841 |
| 3 |
13.5* |
54.8* |
-- |
22.2* |
8.6 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 465 |
| B |
1.1* |
97.0* |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 263 |
| A |
85.4* |
-- |
-- |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
15.5* |
-- |
-- |
59.0* |
24.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 161 |
| M |
17.8* |
3.6* |
8.7* |
50.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
17.1 | 276 |
| |
| Base Pair (1306:1622)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.3* |
39.5* |
27.1* |
1.0* |
0.1 |
5.6 |
0.2 |
0.1 |
0.2 |
0.5 |
0.1 |
-- |
0.8 |
0.5 |
0.1 |
-- |
5.8 | 841 |
| 3 |
32.5* |
42.2* |
20.2* |
-- |
0.2 |
3.4 |
-- |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 465 |
| B |
0.8* |
58.2* |
35.4* |
-- |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
-- |
90.2* |
2.4* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
12.0* |
62.0* |
-- |
-- |
19.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
92.5* |
3.7* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 161 |
| M |
1.1* |
44.6* |
26.1* |
2.9* |
-- |
4.3 |
0.7 |
-- |
0.7 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.4 |
-- |
17.3 | 276 |
| |
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