23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1343
| Base Pair (1343:1404) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
63.0* |
1.2* |
1.5* |
1.7* |
2.0 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
29.7 | 863 |
| 3 |
90.6* |
1.6* |
2.3* |
1.2* |
3.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 487 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 265 |
| A |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
75.1* |
4.4* |
6.1* |
3.3* |
9.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 181 |
| M |
1.8* |
0.7* |
0.7* |
2.5* |
-- |
0.4 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
92.7 | 276 |
| |
| Base Pair (1344:1403) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
10.1* |
58.2* |
0.3* |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
29.9 | 862 |
| 3 |
0.6* |
17.7* |
81.1* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 486 |
| B |
1.1* |
8.7* |
90.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 264 |
| A |
-- |
68.3* |
31.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
97.0* |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
19.3* |
79.0* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 181 |
| M |
0.7* |
0.4* |
4.0* |
1.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
92.7 | 276 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)