23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1385


Base Pair (1385:1402)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 9.2* 1.6* 17.0* 40.1* 0.2 -- 0.1 -- -- 1.2 -- -- -- 0.1 0.1 0.3 29.9863
3 15.4* 2.7* 27.5* 51.3* 0.2 -- -- -- -- 2.1 -- -- -- 0.2 0.2 -- 0.4487
B 13.2* 4.5* 4.5* 77.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 0.4 -- --265
A 17.1* -- -- 82.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 2.0* -- 5.0* 91.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.0 --100
E 18.2* 0.6* 67.4* 6.6* 0.6 -- -- -- -- 5.5 -- -- -- -- -- -- 1.2181
M 0.7* 0.4* 2.9* 1.8* 0.4 -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 93.2276
 
Base Pair (1386:1401)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 2.1* 55.9* 8.7* 2.0* 0.1 0.2 -- 0.3 -- -- 0.1 0.2 -- -- -- 0.1 30.2863
3 3.3* 79.1* 13.3* 3.1* -- 0.4 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 0.4487
B 1.5* 78.9* 19.2* -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- --265
A 17.1* 75.6* 7.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- 97.0* 2.0* 1.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 2.8* 80.1* 6.1* 8.3* -- 1.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6 1.2181
M 0.7 -- 2.9* 0.4 0.4 -- -- 1.1* -- -- -- 0.7* -- -- -- -- 93.8276
 
Base Pair (1387:1400)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 17.1* 9.5* 6.0* 32.6* 2.7 0.1 0.1 0.1 -- -- -- -- 1.0 0.1 0.1 0.1 30.3861
3 28.7* 16.9* 9.9* 36.9* 4.5 -- 0.2 0.2 -- -- -- -- 1.9 0.2 0.2 -- 0.4485
B 17.1* 11.8* 15.6* 55.1* -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- --263
A 63.4* 12.2* 7.3* 14.6* 2.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 5.0* -- -- 93.0* 1.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --100
E 37.6* 25.4* 2.2* 15.5* 11.6 -- 0.6 -- -- -- -- -- 5.0 0.6 0.6 -- 1.2181
M 1.1* -- 1.4* 3.3* -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 93.8276
 
Base Pair (1388:1399)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 65.8* 0.9* 0.7* 1.5* 0.2 -- -- -- -- -- -- 0.1 -- 0.1 -- -- 30.5863
3 96.1* 1.4* -- 1.4* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 0.6487
B 95.8* 2.3* -- 1.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- 0.4265
A 92.7* -- -- 7.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 96.0* -- -- 3.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0100
E 97.2* 0.6* -- 0.6* 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.2181
M 1.4* 0.4* 2.2* 1.1* 0.4 -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- -- 94.2276
 
Base Pair (1389:1398)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 66.0* -- 0.9* 1.7* 0.5 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- 0.1 -- -- 30.4863
3 96.5* -- 0.4* 1.8* 0.4 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6487
B 98.5* -- -- 0.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8265
A 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 98.0 -- -- -- 2.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 92.8* -- 1.1* 3.9* 1.1 -- -- 0.6 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6181
M 0.7* -- 2.2* 2.2* -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- 0.4 -- -- 94.2276
 

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