23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1385
Base Pair (1385:1402)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
9.2* |
1.6* |
17.0* |
40.1* |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.3 |
29.9 | 863 |
3 |
15.4* |
2.7* |
27.5* |
51.3* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.4 | 487 |
B |
13.2* |
4.5* |
4.5* |
77.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- | 265 |
A |
17.1* |
-- |
-- |
82.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
2.0* |
-- |
5.0* |
91.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 100 |
E |
18.2* |
0.6* |
67.4* |
6.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 181 |
M |
0.7* |
0.4* |
2.9* |
1.8* |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
93.2 | 276 |
|
Base Pair (1386:1401)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
2.1* |
55.9* |
8.7* |
2.0* |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
30.2 | 863 |
3 |
3.3* |
79.1* |
13.3* |
3.1* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.4 | 487 |
B |
1.5* |
78.9* |
19.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 265 |
A |
17.1* |
75.6* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
97.0* |
2.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
2.8* |
80.1* |
6.1* |
8.3* |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.2 | 181 |
M |
0.7 |
-- |
2.9* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.8 | 276 |
|
Base Pair (1387:1400)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
17.1* |
9.5* |
6.0* |
32.6* |
2.7 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
30.3 | 861 |
3 |
28.7* |
16.9* |
9.9* |
36.9* |
4.5 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.4 | 485 |
B |
17.1* |
11.8* |
15.6* |
55.1* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
A |
63.4* |
12.2* |
7.3* |
14.6* |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
5.0* |
-- |
-- |
93.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
E |
37.6* |
25.4* |
2.2* |
15.5* |
11.6 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.0 |
0.6 |
0.6 |
-- |
1.2 | 181 |
M |
1.1* |
-- |
1.4* |
3.3* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
93.8 | 276 |
|
Base Pair (1388:1399)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
65.8* |
0.9* |
0.7* |
1.5* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
30.5 | 863 |
3 |
96.1* |
1.4* |
-- |
1.4* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.6 | 487 |
B |
95.8* |
2.3* |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 | 265 |
A |
92.7* |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
96.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
E |
97.2* |
0.6* |
-- |
0.6* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 181 |
M |
1.4* |
0.4* |
2.2* |
1.1* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
94.2 | 276 |
|
Base Pair (1389:1398)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
66.0* |
-- |
0.9* |
1.7* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
30.4 | 863 |
3 |
96.5* |
-- |
0.4* |
1.8* |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 487 |
B |
98.5* |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 265 |
A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
92.8* |
-- |
1.1* |
3.9* |
1.1 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 181 |
M |
0.7* |
-- |
2.2* |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
94.2 | 276 |
|
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