23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1445
| Base Pair (1445:1466)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.5 |
4.3* |
0.1* |
1.6 |
35.1* |
3.1 |
0.1 |
3.3* |
0.5 |
1.0 |
0.9 |
0.6 |
0.2 |
3.0 |
0.3 |
3.1 |
41.0 | 861 |
| 3 |
2.1 |
5.6* |
-- |
2.1 |
57.7* |
5.2 |
0.2 |
5.8* |
0.8 |
1.9 |
1.6 |
1.0 |
0.4 |
5.4 |
0.6 |
5.4 |
4.2 | 485 |
| B |
1.5 |
9.5* |
-- |
0.8 |
56.4* |
9.5 |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
1.9 |
1.9 |
0.4 |
-- |
-- |
9.5 |
7.6 | 264 |
| A |
7.3 |
-- |
-- |
9.8 |
9.8* |
-- |
2.4 |
61.0* |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- | 41 |
| C |
2.0 |
9.0* |
-- |
3.0 |
27.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
59.0 | 100 |
| E |
1.7 |
1.1 |
-- |
2.2 |
70.6* |
-- |
-- |
-- |
2.2* |
5.0* |
-- |
-- |
0.6 |
14.4 |
1.1* |
0.6 |
0.6 | 180 |
| M |
0.4* |
0.4 |
0.4 |
0.4* |
-- |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
97.4 | 276 |
| |
| Base Pair (1446:1465)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.3 |
30.4* |
1.2* |
7.0 |
18.7* |
1.9 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
0.1 |
0.3 |
-- |
0.6 |
32.4 | 861 |
| 3 |
10.5 |
48.9* |
1.0* |
4.9 |
30.1* |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
1.0 |
0.2 |
0.6 |
-- |
0.2 |
0.4 | 485 |
| B |
1.5 |
82.2* |
-- |
3.8 |
6.4* |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.5 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 264 |
| A |
12.2 |
36.6* |
-- |
2.4 |
48.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
3.0* |
30.0* |
3.0* |
35.0* |
10.0 |
7.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
9.0 | 100 |
| E |
23.3 |
2.8* |
2.8* |
7.2 |
60.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.7 |
-- |
0.6 |
0.6 | 180 |
| M |
-- |
-- |
0.7* |
0.4* |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
97.4 | 276 |
| |
| Base Pair (1447:1464)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.7* |
26.4* |
7.1* |
10.6* |
2.8 |
0.8 |
0.2 |
0.5 |
5.2 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
32.6 | 860 |
| 3 |
21.1* |
31.6* |
11.6* |
18.0* |
4.8 |
1.2 |
0.4 |
0.8 |
9.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.4 | 484 |
| B |
30.8* |
41.1* |
15.2* |
9.5* |
0.4 |
2.3 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
2.4* |
68.3* |
26.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
7.0* |
73.0* |
2.0* |
4.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
10.0 | 100 |
| E |
11.1* |
9.4* |
2.8* |
34.4* |
12.2 |
-- |
0.6 |
2.2 |
24.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
0.6 |
0.6 |
0.6 | 180 |
| M |
-- |
-- |
1.1* |
0.4* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
97.5 | 276 |
| |
| Base Pair (1448:1463)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
16.3* |
9.4* |
10.9* |
27.6* |
2.4 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
32.4 | 861 |
| 3 |
24.3* |
14.2* |
9.7* |
47.0* |
4.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 485 |
| B |
33.7* |
24.6* |
9.8* |
28.4* |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- | 264 |
| A |
51.2* |
7.3* |
7.3* |
22.0* |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
27.0* |
8.0* |
44.0* |
6.0* |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
10.0 | 100 |
| E |
4.4* |
0.6* |
10.0* |
80.0* |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 180 |
| M |
-- |
-- |
1.1* |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.5 | 276 |
| |
| Base Pair (1449:1462)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
48.7* |
1.9* |
2.6* |
12.3* |
1.3 |
0.6 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
32.2 | 861 |
| 3 |
75.9* |
2.9* |
3.7* |
14.0* |
2.1 |
0.6 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 485 |
| B |
62.1* |
3.8* |
6.1* |
23.5* |
3.8 |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 264 |
| A |
75.6* |
9.8* |
2.4* |
2.4* |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
47.0* |
2.0* |
4.0* |
36.0* |
1.0 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.0 | 100 |
| E |
96.1* |
-- |
0.6* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 180 |
| M |
-- |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
97.5 | 276 |
| |
| Base Pair (1450:1461)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
16.3* |
17.0* |
2.6* |
20.3* |
0.8 |
1.3 |
1.3 |
0.2 |
0.1 |
0.3 |
0.2 |
1.4 |
0.3 |
-- |
-- |
1.3 |
36.5 | 861 |
| 3 |
27.0* |
29.9* |
3.9* |
32.0* |
0.6 |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.2 |
0.4 |
-- |
-- |
1.9 |
2.7 | 485 |
| B |
36.7* |
43.9* |
7.2* |
2.3* |
0.4 |
0.4 |
-- |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
3.4 |
3.8 | 264 |
| A |
78.0* |
12.2* |
-- |
2.4* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
10.0* |
1.0 |
1.0 |
13.0* |
4.0 |
9.0* |
11.0 |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
9.0 |
1.0 |
-- |
-- |
2.0 |
36.0 | 100 |
| E |
1.1* |
13.3* |
-- |
82.2* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 180 |
| M |
-- |
-- |
0.7* |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.5 | 276 |
| |
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