23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1627
| Base Pair (1627:1639)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
17.3* |
0.2* |
5.0* |
35.2* |
12.1 |
-- |
0.7 |
0.1 |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.4 |
27.3 | 838 |
| 3 |
17.4* |
0.4* |
9.1* |
57.5* |
14.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
0.2 | 461 |
| B |
30.0* |
-- |
-- |
44.5* |
24.7 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- | 263 |
| A |
-- |
-- |
92.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- | 41 |
| C |
62.0* |
-- |
-- |
15.0* |
20.0 |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 100 |
| E |
0.6* |
1.3* |
2.5* |
94.3* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 157 |
| M |
1.1* |
-- |
-- |
5.4* |
5.4 |
-- |
1.8 |
-- |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
82.4 | 277 |
| |
| Base Pair (1628:1638)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
67.2* |
0.4* |
0.1* |
2.0* |
2.6 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.4 | 838 |
| 3 |
94.6* |
0.2* |
-- |
1.7* |
2.6 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 461 |
| B |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 263 |
| A |
61.0* |
2.4* |
-- |
19.5* |
17.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
1.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
97.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 157 |
| M |
10.5* |
0.7* |
0.4* |
2.9* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.4 | 277 |
| |
| Base Pair (1629:1637)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
30.6* |
1.0* |
29.4* |
11.1* |
0.6 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
27.2 | 837 |
| 3 |
55.4* |
1.1* |
22.4* |
19.8* |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 460 |
| B |
28.6* |
0.8* |
37.4* |
32.8* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 262 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
88.5* |
1.9* |
3.2* |
3.2* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 157 |
| M |
0.4* |
1.1* |
15.5* |
0.7* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
81.9 | 277 |
| |
| Base Pair (1630:1636)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.4* |
3.8 |
2.0 |
34.8* |
-- |
17.0* |
0.4 |
-- |
0.1 |
0.1* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
10.3 |
27.0 | 843 |
| 3 |
7.7* |
5.6 |
2.6 |
34.3* |
-- |
30.7* |
0.6 |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
18.0 |
0.2 | 466 |
| B |
3.0* |
4.9* |
1.1* |
57.6* |
-- |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.8 |
0.4 | 264 |
| A |
68.3* |
26.8* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
1.0* |
96.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 |
-- | 100 |
| E |
-- |
1.2 |
4.3 |
4.9* |
-- |
86.4* |
1.9 |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 162 |
| M |
0.4* |
2.2* |
1.4* |
13.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
82.0 | 277 |
| |
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