23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1775


Base Pair (1775:1789)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T -- 1.0* 97.3* 0.4* -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.5 0.8 --842
3 -- -- 98.9 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- 0.9 -- --458
B -- -- 99.6 -- -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- --261
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E -- -- 97.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.6 -- --156
M -- 2.8* 93.6* 1.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.5 --283
 
Base Pair (1776:1788)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 99.6* -- -- 0.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --843
3 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --459
B 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --262
A 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --101
E 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --156
M 98.9* -- -- 1.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --283
 
Base Pair (1777:1787)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* 0.5* 97.6* -- -- 1.3 -- -- 0.1 -- -- -- -- -- -- 0.1 0.2842
3 -- 0.2* 98.9* -- -- 0.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.4459
B -- 0.4* 98.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8262
A -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- 3.0* 96.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.0 --101
E -- -- 98.7 -- -- 1.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --156
M 0.4* -- 96.1* -- -- 3.2 -- -- 0.4* -- -- -- -- -- -- -- --282
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)