23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1830
| Base Pair (1830:1975)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
42.2* |
5.5 |
9.9 |
2.8 |
0.7 |
0.8* |
0.4 |
1.8 |
1.8 |
0.1 |
3.0 |
0.1 |
0.4 |
7.9 |
22.4* |
0.2 | 836 |
| 3 |
-- |
52.1* |
2.1 |
5.8 |
1.4 |
0.7 |
0.5 |
0.5* |
1.9 |
0.5 |
-- |
0.9 |
0.2* |
-- |
0.5 |
33.1* |
-- | 432 |
| B |
-- |
92.8* |
3.0* |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
0.8* |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
14.6* |
2.4* |
56.1* |
14.6 |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
0.6 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.9* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.3 |
92.3* |
-- | 155 |
| M |
-- |
10.2* |
12.2 |
19.1* |
4.6 |
1.0 |
1.7 |
0.3 |
2.3 |
4.3 |
0.3 |
6.6 |
-- |
1.0 |
21.1* |
14.5 |
0.6 | 303 |
| |
| Base Pair (1831:1974)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
59.2* |
1.0* |
25.9* |
10.2* |
3.0 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- | 835 |
| 3 |
44.4* |
0.9* |
43.3* |
8.8* |
2.1 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 432 |
| B |
78.8* |
-- |
2.1* |
14.4* |
3.8 |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
14.6* |
9.8* |
65.9* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
90.1* |
-- |
-- |
6.9* |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
69.9* |
1.3* |
9.6* |
13.2* |
4.3 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- | 302 |
| |
| Base Pair (1832:1973)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
76.9* |
3.5* |
0.1* |
-- |
18.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.6 | 836 |
| 3 |
-- |
64.8 |
-- |
-- |
-- |
35.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 432 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
97.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
86.8* |
9.2* |
0.3* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 | 303 |
| |
| Base Pair (1833:1972)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
97.3* |
2.0* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 844 |
| 3 |
0.2* |
99.1* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 432 |
| B |
0.4* |
98.3* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 236 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
94.2* |
4.5* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 311 |
| |
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