23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 1906
| Base Pair (1906:1924)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
65.7* |
27.8* |
2.1* |
1.7* |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
1.5 | 845 |
| 3 |
97.0* |
1.6* |
-- |
0.2* |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 433 |
| B |
96.2* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 237 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
96.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
97.4* |
-- |
-- |
0.6* |
1.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
12.2* |
73.3* |
5.8* |
3.5* |
0.3 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 311 |
| |
| Base Pair (1907:1923)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7 |
0.2* |
-- |
0.1 |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 850 |
| 3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
99.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
99.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.6 |
0.6* |
-- |
0.3 |
94.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Base Pair (1908:1922)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.1* |
67.8* |
7.2* |
0.1* |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 850 |
| 3 |
44.5* |
48.9* |
5.3* |
0.2* |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
88.4* |
9.5* |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
81.2* |
18.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
90.0* |
6.1* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 311 |
| |
| Base Pair (1909:1921)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.4* |
39.1* |
1.2* |
23.4* |
0.7 |
1.6 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
1.5 | 850 |
| 3 |
11.6* |
49.1* |
-- |
37.7* |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 438 |
| B |
8.7* |
88.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 242 |
| A |
73.2* |
-- |
-- |
26.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
86.1* |
6.9* |
4.0* |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
0.6* |
-- |
99.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
69.5* |
9.6* |
1.0* |
9.6* |
1.9 |
3.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
3.5 | 311 |
| |
| Base Pair (1910:1920)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
94.0* |
0.1 |
-- |
0.8* |
0.1 |
2.6* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
1.4 | 850 |
| 3 |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
86.5* |
0.3 |
-- |
1.3* |
-- |
7.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
3.8 | 311 |
| |
| Base Pair (1911:1919)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
1.5 | 852 |
| 3 |
-- |
-- |
98.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 | 440 |
| B |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 244 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
| E |
-- |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 311 |
| |
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