23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2093
Base Pair (2093:2196)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
66.0* |
-- |
-- |
1.8* |
0.1 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
31.6 | 847 |
3 |
98.6* |
-- |
-- |
1.1* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
B |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
96.8* |
-- |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
8.7* |
-- |
-- |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2094:2195)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
8.0* |
3.7* |
18.9* |
19.8* |
14.9 |
1.5 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
31.6 | 847 |
3 |
5.9* |
6.4* |
32.0* |
31.4* |
19.9 |
2.7 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- | 437 |
B |
4.6* |
4.6* |
-- |
54.8* |
34.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- | 241 |
A |
34.1* |
24.4* |
17.1* |
12.2* |
9.8 |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
40.6* |
1.0* |
-- |
17.8* |
38.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 101 |
E |
0.6* |
4.5* |
85.8* |
-- |
-- |
7.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
0.3* |
0.6* |
6.5* |
4.2* |
-- |
0.3 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2095:2194)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
7.3 |
5.1* |
7.0* |
19.4 |
24.1* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.8 |
0.9 |
31.6 | 847 |
3 |
13.5 |
8.2* |
9.6* |
30.7 |
31.1* |
3.2 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
1.4 |
0.7 |
-- | 437 |
B |
5.8* |
10.4* |
14.9* |
50.6* |
8.3 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
2.5 |
0.8 |
-- | 241 |
A |
43.9* |
26.8* |
14.6* |
-- |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
2.0* |
4.0* |
13.9 |
64.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.9 |
-- |
-- |
1.0 |
4.0 |
-- | 101 |
E |
17.4 |
-- |
-- |
7.7 |
73.5* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
1.0* |
1.6* |
4.2* |
5.2* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2096:2193)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
3.4* |
9.6* |
20.2* |
25.7* |
3.0 |
0.9 |
0.9 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
2.8 |
0.2 |
31.8 | 846 |
3 |
6.0* |
17.7* |
14.7* |
44.3* |
5.7 |
1.6 |
1.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
5.5 |
0.2 |
0.2 | 436 |
B |
5.8* |
27.5* |
25.4* |
20.0* |
6.7 |
2.9 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
10.0 |
-- |
0.4 | 240 |
A |
12.2 |
26.8* |
7.3 |
9.8 |
17.1* |
-- |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
3.0* |
93.1* |
3.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
4.5* |
-- |
-- |
91.0* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
1.0* |
0.3* |
4.2* |
6.8* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2097:2192)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.5* |
5.3* |
22.6* |
22.7* |
1.4 |
7.3 |
0.9 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
32.0 | 847 |
3 |
12.4* |
9.4* |
20.1* |
41.6* |
2.3 |
12.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- | 437 |
B |
17.4* |
6.2* |
34.0* |
20.7* |
-- |
20.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
61.0* |
14.6* |
2.4* |
2.4 |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
2.0* |
90.1* |
-- |
-- |
6.9 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
7.7* |
0.6* |
-- |
84.5* |
5.8 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
0.3* |
0.6* |
3.9* |
3.2* |
0.6 |
0.3 |
2.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
87.7 | 309 |
|
Base Pair (2098:2191)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
7.9* |
8.7 |
14.8 |
12.5* |
2.6 |
17.7* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.4 |
0.5 |
-- |
1.8 |
0.8 |
31.6 | 847 |
3 |
14.2* |
6.6* |
23.8* |
22.4* |
4.6 |
22.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.7 |
-- |
-- |
3.4 |
1.1 |
-- | 437 |
B |
3.3* |
10.4 |
38.2 |
0.4 |
0.4 |
39.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
6.2 |
-- |
-- | 241 |
A |
22.0* |
9.8* |
17.1* |
31.7* |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- | 41 |
C |
-- |
38.6 |
12.9 |
-- |
-- |
47.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 101 |
E |
29.0* |
-- |
3.2* |
54.2* |
12.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 155 |
M |
1.6* |
1.9* |
2.6* |
2.6* |
0.6 |
1.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
0.3 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2099:2190)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.7 |
15.2 |
9.8 |
10.0* |
0.9 |
18.4* |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.8 |
0.5* |
-- |
11.0* |
0.4 |
0.1 |
0.2 |
31.6 | 847 |
3 |
0.9* |
27.0 |
16.2 |
16.0* |
1.8 |
35.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.7 |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- | 437 |
B |
-- |
23.7 |
10.0 |
9.5* |
2.9 |
51.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2* |
0.8 |
0.4 |
-- |
-- | 241 |
A |
4.9* |
53.7* |
7.3* |
-- |
-- |
24.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
2.0 |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
89.1* |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
1.3* |
25.2* |
28.4* |
30.3* |
0.6 |
14.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
-- |
3.6* |
3.9* |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.6 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2100:2189)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
7.3 |
0.6 |
2.2 |
4.4 |
47.9* |
3.9* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
31.7 | 847 |
3 |
13.5 |
-- |
0.9 |
5.7 |
72.1* |
5.9* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
B |
8.3 |
-- |
-- |
1.7 |
79.3* |
10.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
43.9* |
-- |
-- |
4.9 |
36.6 |
-- |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
1.0* |
7.9 |
90.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
13.5 |
-- |
2.6* |
12.3 |
70.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
M |
1.0* |
1.6* |
4.5* |
1.3* |
-- |
2.3 |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2101:2188)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
21.5* |
0.5* |
4.0* |
27.2* |
13.3 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.2 |
31.7 | 847 |
3 |
19.7* |
0.9* |
4.3* |
47.8* |
25.4 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.9 |
-- |
-- |
-- | 437 |
B |
22.0 |
1.7* |
5.8* |
29.9 |
39.4* |
0.4 |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
65.9* |
-- |
-- |
2.4* |
22.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
93.1* |
-- |
2.0* |
4.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
3.9* |
-- |
3.2* |
87.7* |
4.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
0.6* |
-- |
4.2* |
5.5* |
0.3 |
-- |
0.3 |
1.0 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
87.0 | 309 |
|
Base Pair (2102:2187)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
4.5* |
27.6* |
18.1* |
8.0* |
3.5 |
4.0 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
0.7 |
-- |
0.9 |
31.6 | 847 |
3 |
8.0* |
34.6* |
27.9* |
13.5* |
5.9 |
6.6 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.5 |
1.1 |
-- |
0.7 |
-- | 437 |
B |
2.9* |
6.2* |
42.7* |
24.5* |
10.8 |
10.4 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- | 241 |
A |
29.3* |
29.3* |
31.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
82.2* |
10.9* |
-- |
-- |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 101 |
E |
10.3* |
80.0* |
3.9* |
-- |
-- |
2.6 |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
1.0* |
-- |
6.5* |
2.9* |
1.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.0 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2103:2186)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
2.0* |
10.3* |
24.1* |
18.5* |
2.4 |
4.6 |
0.4 |
1.2 |
-- |
0.6 |
0.1 |
0.4 |
0.2 |
-- |
1.2 |
2.1 |
32.0 | 847 |
3 |
3.7* |
17.8* |
25.6* |
33.4* |
4.6 |
6.9 |
0.5 |
1.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
2.1 |
3.4 |
-- | 437 |
B |
3.7* |
20.3* |
15.8* |
39.4* |
5.4 |
4.6 |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
2.9 |
6.2 |
-- | 241 |
A |
9.8* |
68.3* |
7.3* |
7.3* |
2.4 |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
5.9* |
78.2* |
1.0* |
-- |
8.9 |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 |
-- | 101 |
E |
1.9* |
0.6* |
45.8* |
31.0* |
3.9 |
11.0 |
1.3 |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
1.3 |
-- |
-- | 155 |
M |
0.3* |
1.0* |
4.2* |
3.2* |
-- |
-- |
0.3 |
1.6 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
87.7 | 309 |
|
Base Pair (2104:2185) (Tertiary)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
2.7* |
15.5* |
24.6* |
5.3* |
1.8 |
9.3 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
5.8 |
0.1 |
-- |
1.4 |
1.7 |
31.6 | 846 |
3 |
4.6* |
23.4* |
39.9* |
8.3* |
3.2 |
6.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
10.6 |
-- |
-- |
2.3 |
1.4 |
-- | 436 |
B |
0.8* |
37.9* |
16.7* |
11.2* |
-- |
8.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
19.2 |
-- |
-- |
4.2 |
1.2 |
-- | 240 |
A |
43.9* |
7.3* |
4.9* |
12.2* |
29.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- | 41 |
C |
-- |
24.8 |
25.7 |
-- |
1.0* |
48.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
-- |
5.2* |
85.2* |
2.6* |
1.3 |
3.9 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 155 |
M |
1.0* |
1.3* |
2.6* |
2.9* |
-- |
1.0 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
0.3 |
-- |
0.6 |
2.6 |
86.4 | 309 |
|
Base Pair (2105:2184)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
11.9* |
5.2* |
17.6* |
15.8* |
9.2 |
3.7 |
0.1 |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
-- |
1.2 |
-- |
0.8 |
0.5 |
1.7 |
31.6 | 847 |
3 |
22.9* |
8.0* |
13.7* |
26.5* |
17.6 |
4.6 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
1.6 |
0.9 |
1.6 |
-- | 437 |
B |
23.2* |
7.9* |
19.9* |
27.4* |
9.1 |
4.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.1 |
-- |
1.2 |
-- |
2.5 |
-- | 241 |
A |
29.3* |
29.3* |
17.1* |
-- |
9.8 |
12.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- | 41 |
C |
1.0* |
3.0* |
78.2* |
4.0* |
-- |
7.9 |
1.0 |
1.0 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 101 |
E |
20.6 |
2.6* |
3.2* |
32.3 |
32.9* |
2.6 |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
2.6 |
-- |
-- | 155 |
M |
-- |
1.9* |
3.2* |
4.5* |
0.3 |
1.0 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
86.7 | 309 |
|
Base Pair (2106:2183)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
14.5* |
2.0* |
17.9* |
16.9* |
11.1 |
3.7 |
0.2 |
0.5 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 |
0.5 |
0.5 |
31.6 | 847 |
3 |
25.9* |
3.2* |
13.5* |
29.1* |
20.8 |
5.5 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.9 |
0.2 |
-- | 437 |
B |
30.7* |
1.7* |
20.7* |
17.8* |
21.6 |
5.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
1.7 |
-- |
-- | 241 |
A |
34.1* |
22.0* |
14.6* |
2.4* |
19.5 |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
2.0* |
81.2* |
5.9* |
-- |
5.0 |
2.0 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 | 101 |
E |
16.1* |
0.6 |
1.9 |
53.5* |
20.0 |
5.8* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
3.2* |
0.3* |
3.6* |
3.2* |
1.0 |
0.6 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
86.1 | 309 |
|
Base Pair (2107:2182)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
13.1* |
24.2* |
9.1* |
7.8* |
9.1 |
3.3 |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
-- |
0.2 |
31.4 | 847 |
3 |
24.0* |
27.2* |
12.1* |
11.0* |
17.4 |
5.7 |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
0.2 |
0.9 |
-- |
0.2 |
-- | 437 |
B |
5.0 |
46.9* |
19.9* |
6.2 |
11.6* |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
1.7 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
41.5* |
9.8 |
-- |
17.1* |
9.8 |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
85.1* |
10.9* |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 101 |
E |
49.0* |
1.3* |
3.2* |
16.8* |
28.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
1.9* |
-- |
4.2* |
5.8* |
0.3 |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
86.1 | 309 |
|
Base Pair (2108:2181)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.6* |
7.1 |
4.7 |
29.9* |
0.5 |
17.1* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
1.1 |
1.1 |
31.5 | 846 |
3 |
12.2* |
11.2 |
2.8 |
52.5* |
0.9 |
18.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
0.2 |
-- | 436 |
B |
1.2* |
18.3 |
3.8 |
40.4* |
-- |
32.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.3 |
-- |
-- | 240 |
A |
56.1* |
2.4* |
2.4* |
31.7* |
4.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
10.9 |
20.8 |
-- |
-- |
63.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- | 101 |
E |
17.4* |
2.6* |
1.3* |
76.8* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
M |
1.0* |
-- |
2.3* |
7.8* |
-- |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 |
86.4 | 309 |
|
Base Pair (2109:2180) (Tertiary)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
18.1* |
-- |
3.9 |
0.5 |
0.1 |
1.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.6 |
42.7* |
32.0 | 847 |
3 |
34.1* |
-- |
5.0 |
0.2 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.9 |
56.3* |
0.2 | 437 |
B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- | 241 |
A |
-- |
-- |
53.7 |
-- |
-- |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.8 |
14.6 |
-- | 41 |
C |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
97.0 |
-- | 101 |
E |
96.1* |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
M |
1.3* |
-- |
3.6 |
0.6 |
0.3 |
-- |
0.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
5.8* |
87.6 | 309 |
|
Base Pair (2110:2179)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
46.4* |
-- |
0.8* |
2.0* |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
-- |
17.9 |
-- |
-- |
-- |
32.3 | 847 |
3 |
63.6* |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
33.9 |
-- |
-- |
-- |
1.1 | 437 |
B |
99.2* |
-- |
-- |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
92.7* |
-- |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
97.0* |
-- |
-- |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 101 |
E |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
95.5* |
-- |
-- |
-- |
3.2 | 155 |
M |
5.5* |
-- |
2.3* |
2.9* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
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87.0 | 309 |
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