23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2117
Base Pair (2117:2172) (Tertiary)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
5.4* |
7.7* |
0.6* |
49.2* |
0.4 |
-- |
0.7 |
-- |
0.5 |
0.4 |
-- |
0.2 |
0.8 |
-- |
-- |
2.5 |
31.6 | 847 |
3 |
8.9* |
-- |
-- |
88.8* |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7* |
-- |
0.5 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- | 437 |
B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
85.4* |
-- |
-- |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
2.0* |
64.4* |
-- |
11.9 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
20.8* |
-- | 101 |
E |
2.6* |
-- |
-- |
91.0* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9* |
-- |
1.3 |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
M |
1.6* |
-- |
1.6* |
5.5* |
0.3 |
-- |
1.9 |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
86.7 | 309 |
|
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