23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 224


Base Pair (224:231)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 20.9* 19.0* 25.5* 9.7* -- -- 0.5 -- -- 0.1 -- -- 0.1 -- -- -- 24.2865
3 16.6* 31.9* 35.8* 15.5* -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- --511
B 27.4* -- 59.9* 12.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --277
A 22.2* 30.6* 36.1* 11.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C 96.0* -- -- 4.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 0.5* 76.8* 2.0* 20.2* -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- -- -- -- --198
M -- 0.4* 15.0* 0.4* -- -- 1.6 -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- 82.3254
 
Base Pair (225:230)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1* 51.3* 19.4* 3.7* 0.1 -- -- -- 0.2 0.1 -- 0.1 -- -- -- 0.6 24.3863
3 0.2* 60.7* 31.4* 6.1* -- -- -- -- 0.4 0.2 -- 0.2 -- -- -- 0.6 0.2509
B -- 85.9* 2.2* 11.2* -- -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- --276
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- 95.0* 5.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --100
E 0.5* 18.3* 78.2* -- -- -- -- -- -- 0.5 -- 0.5 -- -- -- 1.5 0.5197
M -- 15.4* 0.8* 0.4 0.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8 82.3254
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)