23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 224
Base Pair (224:231)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
20.9* |
19.0* |
25.5* |
9.7* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
24.2 | 865 |
3 |
16.6* |
31.9* |
35.8* |
15.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 511 |
B |
27.4* |
-- |
59.9* |
12.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 277 |
A |
22.2* |
30.6* |
36.1* |
11.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
96.0* |
-- |
-- |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
0.5* |
76.8* |
2.0* |
20.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 198 |
M |
-- |
0.4* |
15.0* |
0.4* |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
82.3 | 254 |
|
Base Pair (225:230)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.1* |
51.3* |
19.4* |
3.7* |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
24.3 | 863 |
3 |
0.2* |
60.7* |
31.4* |
6.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 | 509 |
B |
-- |
85.9* |
2.2* |
11.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 276 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
-- |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
E |
0.5* |
18.3* |
78.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
1.5 |
0.5 | 197 |
M |
-- |
15.4* |
0.8* |
0.4 |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
82.3 | 254 |
|
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