23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2246
| Base Pair (2246:2258)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
76.7* |
2.6* |
5.5* |
8.4* |
2.2 |
-- |
0.8 |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.4 |
-- |
0.5 |
0.6 | 849 |
| 3 |
87.9* |
-- |
1.8* |
5.7* |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 438 |
| B |
83.5* |
-- |
3.3* |
10.3* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
36.3* |
19.6* |
12.7* |
25.5* |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- | 102 |
| E |
91.6 |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
| M |
74.1* |
0.6* |
8.4* |
6.5* |
2.3 |
-- |
2.3 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
1.0 |
-- |
0.3 |
0.3 | 309 |
| |
| Base Pair (2247:2257)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
43.4* |
0.7* |
9.1* |
44.0* |
2.0 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 | 848 |
| 3 |
31.4* |
-- |
0.9* |
62.9* |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
0.8* |
-- |
-- |
98.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
80.0* |
-- |
-- |
17.5* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 40 |
| C |
-- |
2.9* |
55.9* |
41.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
66.5* |
-- |
2.6* |
19.4* |
8.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
74.8* |
1.0* |
5.2* |
18.1* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 309 |
| |
| Base Pair (2248:2256)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.2* |
63.8* |
32.3* |
1.9* |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 849 |
| 3 |
0.9* |
98.2* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 438 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 242 |
| A |
9.8* |
90.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
68.6* |
18.6* |
12.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
1.9* |
13.6* |
82.5* |
1.0* |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 309 |
| |
| Base Pair (2249:2255)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
4.1 |
-- |
-- |
94.6* |
-- |
-- |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 | 845 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 | 434 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 238 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
-- |
-- |
10.7 |
-- |
-- |
87.1* |
-- |
-- |
-- |
1.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- | 309 |
| |
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