23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2259
| Base Pair (2259:2281)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
32.5* |
0.9* |
26.5* |
24.2* |
5.1 |
0.9 |
4.1 |
1.3 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
0.1 |
-- |
0.8 |
0.8 | 848 |
| 3 |
43.9* |
1.1* |
17.6* |
33.9* |
2.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
| B |
67.2* |
-- |
27.8* |
0.8* |
3.3 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
51.2* |
12.2* |
24.4* |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
58.8* |
-- |
4.9* |
18.6* |
11.8 |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 102 |
| E |
5.8* |
-- |
-- |
91.0* |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
0.6 |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
7.8* |
1.0* |
46.3* |
12.3* |
7.1 |
2.6 |
11.3 |
1.9 |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
5.2 |
-- |
-- |
1.6 |
1.9 | 309 |
| |
| Base Pair (2260:2280)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.2* |
69.6* |
9.6* |
2.1* |
0.5 |
12.3 |
1.3 |
-- |
-- |
1.4 |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.5 |
-- |
-- |
1.3 | 848 |
| 3 |
1.1* |
71.6* |
2.5* |
-- |
-- |
23.3 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.4 | 437 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
2.4* |
97.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
88.2* |
7.8* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 102 |
| E |
2.6* |
21.3 |
7.1 |
-- |
-- |
65.8* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
1.6* |
60.5* |
20.1* |
5.8* |
1.3 |
0.3 |
3.2 |
-- |
-- |
3.9 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
1.9 | 309 |
| |
| Base Pair (2261:2279)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
25.5* |
65.7* |
2.9* |
3.7* |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
1.8 | 848 |
| 3 |
2.3* |
95.0* |
1.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
1.1 | 437 |
| B |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 | 241 |
| A |
24.4* |
73.2* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 102 |
| E |
-- |
96.1* |
3.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- | 155 |
| M |
66.7* |
14.2* |
6.1* |
10.0* |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 309 |
| |
| Base Pair (2262:2278)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
25.1* |
5.3* |
63.3* |
4.1* |
-- |
0.4 |
0.9 |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 849 |
| 3 |
1.4* |
8.9* |
89.5* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
92.7* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
97.1 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
3.9* |
0.6* |
94.8* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
67.0* |
1.9* |
14.9* |
11.3* |
-- |
0.3 |
2.3 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 309 |
| |
| Base Pair (2263:2277)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.3* |
46.2* |
6.7* |
27.2* |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.1 |
0.6 | 849 |
| 3 |
32.2* |
60.0* |
6.8* |
0.2* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 438 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
39.0* |
29.3* |
31.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
96.1* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
80.6* |
6.5* |
11.0* |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
4.5* |
10.0* |
8.1* |
74.4* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
1.6 | 309 |
| |
| Base Pair (2264:2276)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
22.7* |
45.7* |
4.1* |
7.8* |
-- |
14.5 |
0.5 |
0.4 |
-- |
2.7 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
1.2 | 849 |
| 3 |
-- |
62.1* |
5.3* |
0.5* |
-- |
27.4 |
-- |
-- |
-- |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 438 |
| B |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 242 |
| A |
-- |
22.0 |
24.4 |
-- |
-- |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
41.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
85.3* |
2.0* |
11.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
15.5 |
8.4 |
1.3* |
-- |
74.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
62.1* |
9.4* |
3.2* |
16.8* |
-- |
1.0 |
1.3 |
1.0 |
-- |
1.9 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
2.3 | 309 |
| |
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