23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2284
Base Pair (2284:2384)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
22.2* |
36.8* |
5.8* |
13.2* |
5.5 |
0.2 |
0.8 |
1.8 |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.4 |
3.3 |
2.7 |
0.5 |
0.6 |
5.8 | 848 |
3 |
3.2* |
67.0* |
8.0* |
11.9* |
8.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 | 437 |
B |
5.8* |
43.2* |
14.5* |
21.2* |
15.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
82.4* |
-- |
-- |
14.7* |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
E |
-- |
95.5* |
-- |
0.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
M |
29.1* |
6.1* |
4.5* |
14.6* |
2.3 |
0.6 |
2.3 |
4.9 |
-- |
0.6 |
0.6 |
1.0 |
9.1 |
6.5 |
1.3 |
1.6 |
14.7 | 309 |
|
Base Pair (2285:2383)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
6.5* |
70.3* |
0.9* |
3.7* |
0.2 |
1.8 |
2.0 |
5.7 |
0.7 |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.5 |
0.4 |
0.1 |
0.1 |
6.4 | 848 |
3 |
-- |
99.5* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 437 |
B |
-- |
99.6* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
E |
-- |
99.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
M |
17.8* |
19.1* |
2.3* |
10.0* |
0.6 |
4.9 |
5.5 |
15.5 |
1.9 |
1.9 |
-- |
0.3 |
1.3 |
1.0 |
0.3 |
0.3 |
17.1 | 309 |
|
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