23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2284


Base Pair (2284:2384)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 22.2* 36.8* 5.8* 13.2* 5.5 0.2 0.8 1.8 -- 0.2 0.2 0.4 3.3 2.7 0.5 0.6 5.8848
3 3.2* 67.0* 8.0* 11.9* 8.5 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- -- 0.7437
B 5.8* 43.2* 14.5* 21.2* 15.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --241
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C 82.4* -- -- 14.7* 2.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --102
E -- 95.5* -- 0.6* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 -- -- 1.9155
M 29.1* 6.1* 4.5* 14.6* 2.3 0.6 2.3 4.9 -- 0.6 0.6 1.0 9.1 6.5 1.3 1.6 14.7309
 
Base Pair (2285:2383)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 6.5* 70.3* 0.9* 3.7* 0.2 1.8 2.0 5.7 0.7 0.7 -- 0.1 0.5 0.4 0.1 0.1 6.4848
3 -- 99.5* 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2437
B -- 99.6* 0.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --241
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --41
C -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --102
E -- 99.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6155
M 17.8* 19.1* 2.3* 10.0* 0.6 4.9 5.5 15.5 1.9 1.9 -- 0.3 1.3 1.0 0.3 0.3 17.1309
 

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