23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2290
| Base Pair (2290:2342)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
57.9* |
2.0* |
0.8* |
7.9* |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.0 | 848 |
| 3 |
80.1* |
3.9* |
1.1* |
13.7* |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 437 |
| B |
95.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
78.0* |
9.8* |
4.9* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
99.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
57.4* |
0.6* |
1.9* |
36.8* |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 155 |
| M |
12.9* |
-- |
0.3* |
2.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
84.1 | 309 |
| |
| Base Pair (2291:2341)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.7* |
6.8 |
3.7 |
0.2* |
-- |
54.7* |
-- |
-- |
0.1 |
0.2* |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.1 |
-- |
31.1 | 848 |
| 3 |
5.0* |
12.4 |
5.5 |
0.2* |
-- |
75.5* |
-- |
-- |
0.2 |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 | 437 |
| B |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
97.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.8 | 241 |
| A |
-- |
4.9 |
7.3 |
-- |
-- |
87.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
97.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
14.2* |
33.5 |
12.3 |
0.6* |
-- |
37.4* |
-- |
-- |
0.6 |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
0.3* |
1.3 |
1.9 |
0.3* |
-- |
11.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.7 | 309 |
| |
| Base Pair (2292:2340)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.3* |
7.9* |
33.5* |
13.1* |
0.7 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.1 |
31.4 | 847 |
| 3 |
23.2* |
14.2* |
42.4* |
17.4* |
1.4 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
0.5 | 436 |
| B |
6.2* |
6.2* |
71.7* |
14.6* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 240 |
| A |
-- |
82.9* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.9* |
91.2* |
2.0* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- | 102 |
| E |
55.5* |
8.4* |
4.5* |
26.5* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- | 155 |
| M |
1.0* |
0.6* |
1.9* |
10.7* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Base Pair (2293:2339)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
14.0* |
26.4* |
4.6* |
21.6* |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.5 | 848 |
| 3 |
25.2* |
32.3* |
4.1* |
37.3* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 | 437 |
| B |
23.7* |
56.8* |
6.6* |
11.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 | 241 |
| A |
73.2* |
-- |
4.9* |
22.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
77.5* |
8.8* |
-- |
-- |
13.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
14.8* |
2.6* |
-- |
81.3* |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
1.3* |
3.9* |
6.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Base Pair (2294:2338)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.0* |
25.7* |
4.6* |
4.6* |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.2 | 846 |
| 3 |
58.6* |
31.0* |
2.8* |
6.9* |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 435 |
| B |
40.2* |
55.2* |
2.9* |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 239 |
| A |
80.5* |
7.3* |
9.8* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
76.5* |
21.6* |
1.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
81.3* |
-- |
0.6* |
16.1* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
7.8* |
1.3* |
1.6* |
2.6* |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.4 | 309 |
| |
| Base Pair (2295:2337)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.1* |
63.0* |
2.1* |
0.6* |
-- |
1.4 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
31.3 | 846 |
| 3 |
-- |
96.3* |
2.1* |
-- |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 435 |
| B |
-- |
96.2* |
1.3* |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 239 |
| A |
-- |
95.1* |
4.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
89.2* |
4.9* |
-- |
-- |
5.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
96.8* |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
7.4* |
1.3* |
1.6* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
85.7 | 309 |
| |
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