23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2323
| Base Pair (2323:2332)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
46.2* |
3.1* |
1.2* |
8.6* |
9.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
31.2 | 848 |
| 3 |
63.8* |
5.5* |
0.9* |
15.3* |
14.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 437 |
| B |
82.2 |
-- |
-- |
-- |
17.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
89.2* |
-- |
-- |
2.9* |
7.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
25.8* |
15.5* |
2.6* |
43.2* |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 | 155 |
| M |
7.1* |
0.6* |
1.9* |
1.0* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
85.1 | 309 |
| |
| Base Pair (2324:2331)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.6* |
20.8 |
1.2 |
0.1* |
-- |
45.9* |
-- |
-- |
-- |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.2 | 848 |
| 3 |
1.1* |
35.2 |
0.2 |
-- |
-- |
62.5* |
-- |
-- |
-- |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 437 |
| B |
-- |
7.1 |
-- |
-- |
-- |
92.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
7.3* |
14.6 |
-- |
-- |
-- |
78.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
2.0 |
2.0 |
-- |
-- |
96.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.3* |
84.5* |
0.6* |
-- |
-- |
11.6 |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
-- |
6.5* |
2.3* |
0.3* |
-- |
5.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
85.1 | 309 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)