23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2372
| Base Pair (2372:2381)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
31.1* |
17.5* |
18.0* |
2.4* |
-- |
0.7 |
0.1 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.1 |
29.7 | 848 |
| 3 |
32.5* |
32.0* |
31.4* |
2.3* |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 | 437 |
| B |
54.8* |
1.2* |
41.1* |
0.8* |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 241 |
| A |
19.5* |
65.9* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 41 |
| C |
93.1* |
-- |
2.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
1.3* |
71.0* |
21.9* |
5.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 155 |
| M |
8.7* |
2.6* |
4.5* |
2.6* |
-- |
1.0 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
79.9 | 309 |
| |
| Base Pair (2373:2380)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
33.8* |
0.7* |
1.4* |
33.7* |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.2 |
29.5 | 848 |
| 3 |
49.9* |
1.1* |
2.1* |
46.0* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 437 |
| B |
23.7* |
-- |
3.7* |
72.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
78.0* |
9.8* |
-- |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.9 | 41 |
| C |
58.8* |
-- |
-- |
41.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
83.2* |
0.6* |
-- |
14.8* |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 155 |
| M |
2.9* |
0.3* |
1.0* |
13.9* |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.6 |
80.2 | 309 |
| |
| Base Pair (2374:2379)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.4* |
49.9* |
0.5* |
1.2* |
0.1 |
13.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
30.8 | 848 |
| 3 |
5.7* |
67.0* |
0.2* |
1.8* |
-- |
23.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
1.1 | 437 |
| B |
2.5* |
93.8* |
-- |
1.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.1 | 241 |
| A |
29.3* |
70.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
93.1 |
-- |
-- |
-- |
2.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 102 |
| E |
4.5* |
24.5 |
0.6 |
2.6* |
-- |
66.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- | 155 |
| M |
1.3* |
11.3* |
1.0* |
0.6* |
0.3 |
1.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
82.1 | 309 |
| |
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