23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2455
| Base Pair (2455:2496)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
45.7* |
30.0* |
-- |
3.7* |
20.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 828 |
| 3 |
56.7* |
-- |
-- |
6.0* |
37.1 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 420 |
| B |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
61.0 |
39.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
12.4* |
81.0* |
-- |
2.0* |
3.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Base Pair (2456:2495)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
32.7* |
47.6* |
0.6* |
2.3* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
16.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- | 829 |
| 3 |
8.6* |
58.7* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
87.8* |
12.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
76.8* |
15.0* |
1.3* |
6.2* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
| Base Pair (2457:2494)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
0.2 |
1.0 |
1.6* |
-- |
73.1* |
0.1 |
-- |
0.4 |
23.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 829 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
0.7 |
2.6 |
4.2* |
-- |
28.1* |
0.3 |
-- |
-- |
64.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 306 |
| |
|
| Base Pair (2459:2493)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
-- |
1.0* |
76.1* |
21.5 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.4 | 829 |
| 3 |
0.5* |
-- |
-- |
57.0* |
42.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 421 |
| B |
0.8* |
-- |
-- |
99.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
1.3* |
-- |
2.6* |
94.4* |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.0 | 306 |
| |
|
| Base Pair (2460:2490)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
-- |
1.2* |
-- |
81.3* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
16.5 |
0.3 | 828 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
67.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.6 |
0.2 | 420 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 241 |
| A |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
99.3 |
0.7 | 138 |
| M |
-- |
-- |
-- |
3.3* |
-- |
94.4* |
0.7 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.6 | 306 |
| |
| Base Pair (2461:2489)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.3 |
62.2* |
4.8* |
10.2 |
16.7* |
0.6 |
0.4 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.2 |
1.3 | 827 |
| 3 |
3.1 |
46.8* |
1.4* |
15.5 |
32.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 419 |
| B |
5.4* |
64.6* |
2.5* |
25.0* |
1.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 240 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
-- |
-- |
3.6 |
96.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
4.6* |
70.9* |
10.8* |
6.2* |
0.3 |
1.6 |
1.0 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.7 |
2.9 | 306 |
| |
| Base Pair (2462:2488)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
23.2* |
29.6* |
34.4* |
7.2* |
0.1 |
1.2 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
1.2 | 828 |
| 3 |
42.9* |
17.1* |
27.9* |
6.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.5 |
0.2 | 420 |
| B |
5.8* |
28.6* |
47.3* |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
9.5 |
0.4 | 241 |
| A |
68.3* |
7.3* |
7.3* |
17.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
3.9* |
56.5* |
21.9* |
10.5* |
0.3 |
3.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.9 | 306 |
| |
| Base Pair (2463:2487)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.7* |
58.4* |
33.4* |
2.2* |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.5 |
1.7 | 829 |
| 3 |
-- |
87.4* |
12.4* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
78.5* |
21.1* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
97.6* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
27.5* |
71.6* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
2.0* |
28.8* |
49.7* |
5.2* |
-- |
8.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
1.3 |
4.6 | 306 |
| |
| Base Pair (2464:2486)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.7* |
43.9* |
10.1* |
23.3* |
0.4 |
1.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
2.0 | 829 |
| 3 |
31.8* |
40.1* |
4.3* |
23.3* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- | 421 |
| B |
33.1* |
62.0* |
3.7* |
0.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
65.9* |
17.1* |
9.8* |
7.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
1.0* |
94.1* |
1.0* |
1.0* |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 102 |
| E |
19.6* |
8.7* |
3.6* |
67.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- | 138 |
| M |
6.5* |
32.4* |
21.2* |
30.7* |
1.0 |
2.0 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
5.2 | 306 |
| |
| Base Pair (2465:2485)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.2 |
43.1* |
30.6* |
1.7 |
15.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
2.0 | 829 |
| 3 |
10.7 |
54.4* |
1.9* |
2.1 |
30.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
0.4* |
92.1* |
3.3* |
3.7* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
85.4* |
14.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
91.2* |
7.8* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
6.5 |
-- |
-- |
-- |
93.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
2.0* |
11.4* |
77.8* |
1.3* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
5.5 | 306 |
| |
| Base Pair (2466:2484)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.4* |
66.7* |
21.5* |
1.0* |
0.6 |
1.8 |
0.2 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 829 |
| 3 |
9.7* |
86.9* |
2.1* |
-- |
1.0 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
99.0* |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
90.6* |
6.5* |
-- |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
1.3* |
28.1* |
55.2* |
2.3* |
0.3 |
4.6 |
0.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 306 |
| |
|
| Base Pair (2470:2480)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
91.8* |
-- |
1.3* |
0.8* |
3.3 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
1.9 | 829 |
| 3 |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
97.1* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- | 102 |
| E |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
78.8* |
-- |
3.6* |
2.3* |
8.5 |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
5.2 | 306 |
| |
| Base Pair (2471:2479)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
17.2* |
0.4* |
80.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.9 | 829 |
| 3 |
-- |
34.0* |
-- |
66.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 421 |
| B |
-- |
3.3* |
-- |
96.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 242 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 41 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 102 |
| E |
-- |
97.8* |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 138 |
| M |
-- |
-- |
1.0* |
93.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 306 |
| |
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