23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 265
| Base Pair (265:427)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.2* |
-- |
0.5* |
72.2* |
1.0 |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
24.7 | 869 |
| 3 |
-- |
-- |
-- |
96.9* |
1.0 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2* |
0.6 |
0.2 | 515 |
| B |
-- |
-- |
-- |
97.5 |
0.7 |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 277 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
-- |
-- |
97.0 |
2.0 |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
-- |
-- |
95.5* |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5* |
1.5 |
0.5 | 202 |
| M |
0.8* |
-- |
1.6* |
12.2* |
0.8 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.3 | 254 |
| |
| Base Pair (266:426)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
71.2* |
-- |
0.1* |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
24.6 | 868 |
| 3 |
94.7* |
-- |
-- |
5.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 514 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 276 |
| A |
97.2* |
-- |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
99.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
87.1* |
-- |
-- |
12.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 202 |
| M |
12.6* |
-- |
0.4* |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
84.3 | 254 |
| |
| Base Pair (267:425)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.1* |
57.4* |
4.0* |
2.4* |
0.2 |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
24.7 | 868 |
| 3 |
14.0* |
77.0* |
4.3* |
3.9* |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 514 |
| B |
23.2* |
67.4* |
2.2* |
6.9* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 276 |
| A |
22.2* |
61.1* |
13.9* |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
89.0* |
6.0* |
-- |
-- |
1.0 |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
93.1* |
5.4* |
0.5* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 202 |
| M |
6.3* |
5.1* |
2.8* |
0.4* |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
84.3 | 254 |
| |
| Base Pair (268:424)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.0* |
59.0* |
10.2* |
0.5* |
-- |
1.4 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.2 |
24.6 | 869 |
| 3 |
4.9* |
76.7* |
15.3* |
0.6* |
-- |
2.1 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 515 |
| B |
6.9* |
93.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 277 |
| A |
16.7* |
72.2* |
2.8* |
8.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
96.0* |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 100 |
| E |
-- |
55.0* |
38.6* |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 202 |
| M |
0.4* |
8.7* |
3.5* |
0.4* |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
0.8 |
84.3 | 254 |
| |
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