23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2791
| Base Pair (2791:2805)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
6.7* |
6.2* |
13.3* |
1.1* |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
71.2 | 656 |
| 3 |
11.5* |
9.7* |
19.7* |
1.8* |
0.8 |
0.8 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.8 |
54.4 | 381 |
| B |
19.1* |
14.9* |
29.3* |
3.3* |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
31.3 | 215 |
| A |
7.5* |
12.5* |
30.0* |
-- |
-- |
7.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
5.0 |
35.0 | 40 |
| C |
-- |
7.1* |
21.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
71.4 | 56 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.1 | 219 |
| |
| Base Pair (2792:2804)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
8.7* |
7.5* |
7.5* |
5.7* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
70.6 | 654 |
| 3 |
15.0* |
10.8* |
11.1* |
9.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
53.3 | 379 |
| B |
20.7* |
14.6* |
18.3* |
17.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
29.1 | 213 |
| A |
32.5* |
25.0* |
7.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
35.0 | 40 |
| C |
-- |
14.3* |
12.5* |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
71.4 | 56 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 219 |
| |
| Base Pair (2793:2803)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
10.1* |
13.2* |
2.5* |
4.8* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
69.1 | 652 |
| 3 |
15.1* |
22.8* |
3.4* |
7.2* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
50.7 | 377 |
| B |
23.2* |
32.7* |
6.2* |
12.8* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
24.2 | 211 |
| A |
20.0* |
42.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
35.0 | 40 |
| C |
16.1* |
-- |
5.4* |
7.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
71.4 | 56 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 219 |
| |
| Base Pair (2794:2802)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.5* |
10.8* |
3.1* |
7.5* |
0.6 |
0.3 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
72.8 | 650 |
| 3 |
7.7* |
17.6* |
3.5* |
12.5* |
1.1 |
0.5 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
56.3 | 375 |
| B |
12.9* |
26.8* |
6.2* |
21.5* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
30.6 | 209 |
| A |
5.0 |
25.0* |
-- |
5.0 |
10.0* |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
52.5 | 40 |
| C |
-- |
7.1* |
12.5* |
3.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
76.8 | 56 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 219 |
| |
| Base Pair (2795:2801)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3* |
7.1* |
1.2* |
2.2* |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
86.7 | 693 |
| 3 |
3.6* |
12.8* |
2.1* |
3.9* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.5 |
-- |
-- |
76.6 | 384 |
| B |
4.6* |
17.9* |
2.8* |
6.4* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.9 |
-- |
-- |
66.6 | 218 |
| A |
10.0* |
25.0* |
5.0* |
2.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
57.5 | 40 |
| C |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 | 90 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 219 |
| |
| Base Pair (2796:2800)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.7* |
0.6* |
4.2* |
0.6* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
91.4 | 693 |
| 3 |
3.1* |
1.0* |
7.0* |
1.0* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
85.2 | 384 |
| B |
-- |
1.4* |
12.4* |
0.9* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
81.7 | 218 |
| A |
30.0* |
2.5 |
-- |
5.0* |
-- |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
57.5 | 40 |
| C |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
97.8 | 90 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
100.0 | 126 |
| M |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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100.0 | 219 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)