23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 2836
| Base Pair (2836:2882)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.2* |
0.7* |
79.7* |
4.5* |
3.8 |
0.5 |
0.7 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.7 |
2.9 | 424 |
| 3 |
6.7* |
0.9* |
77.5* |
4.3* |
4.9 |
0.6 |
0.9 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.6 |
-- |
0.3 |
0.6 |
2.1 | 329 |
| B |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
-- |
96.0* |
4.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
25.6* |
3.5* |
14.0* |
16.3* |
18.6 |
2.3 |
3.5 |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
1.2 |
2.3 |
-- |
1.2 |
2.3 |
8.3 | 86 |
| M |
-- |
-- |
77.8* |
6.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
13.3 | 45 |
| |
| Base Pair (2837:2881)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
12.0* |
10.1* |
1.6* |
70.6* |
-- |
0.9 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
2.7 | 425 |
| 3 |
14.5* |
12.1* |
1.2* |
66.7* |
-- |
1.2 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
1.8 | 330 |
| B |
1.0* |
0.5* |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 205 |
| A |
55.3* |
-- |
-- |
44.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
28.7* |
44.8* |
4.6* |
2.3* |
-- |
4.6 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
2.3 |
2.3 |
-- |
-- |
1.1 |
1.1 |
5.6 | 87 |
| M |
6.7* |
6.7* |
6.7* |
66.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.3 | 45 |
| |
| Base Pair (2838:2880)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
82.8* |
1.7* |
1.2* |
8.3* |
1.9 |
0.2 |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.9 |
0.5 |
-- |
1.6 | 424 |
| 3 |
81.8* |
2.1* |
-- |
10.3* |
2.4 |
0.3 |
0.3 |
0.3 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.9 |
0.6 |
-- |
0.3 | 329 |
| B |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
30.2* |
8.1* |
-- |
39.5* |
9.3 |
1.2 |
1.2 |
1.2 |
-- |
-- |
1.2 |
1.2 |
-- |
3.5 |
2.3 |
-- |
1.2 | 86 |
| M |
73.3* |
-- |
11.1* |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.3 | 45 |
| |
|
| Base Pair (2839:2878)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
3.1 |
1.6* |
4.5* |
11.3 |
71.5* |
0.5 |
0.2 |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.9 |
-- |
1.4 |
2.2 | 425 |
| 3 |
3.3 |
1.5* |
4.2* |
13.9 |
69.1* |
0.6 |
0.3 |
2.4* |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
0.9 |
-- |
1.8 |
1.2 | 330 |
| B |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
97.1* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
7.9 |
-- |
-- |
5.3 |
71.1* |
-- |
-- |
15.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
4.0* |
-- |
4.0 |
92.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
4.6* |
5.7* |
16.1* |
50.6* |
2.3 |
2.3 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
3.4 |
-- |
6.9 |
4.4 | 87 |
| M |
4.4 |
-- |
11.1* |
-- |
66.7* |
-- |
-- |
2.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
13.3 | 45 |
| |
| Base Pair (2840:2877)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
5.9 |
37.8* |
34.0* |
6.4 |
9.0* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.9 |
1.2 |
0.2 |
0.2 |
1.8 | 423 |
| 3 |
7.6 |
38.7* |
30.2* |
5.5 |
11.6* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
1.2 |
1.5 |
0.3 |
0.3 |
0.6 | 328 |
| B |
1.5* |
48.8* |
46.8* |
1.5* |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
51.4* |
27.0* |
2.7* |
10.8* |
8.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
32.0* |
60.0* |
8.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
3.5 |
19.8* |
2.3* |
12.8 |
40.7* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.7 |
4.7 |
5.8 |
1.2 |
1.2 |
2.4 | 86 |
| M |
-- |
37.8* |
33.3* |
11.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.3 | 45 |
| |
| Base Pair (2841:2876)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
16.1* |
33.6* |
25.8* |
12.8* |
6.6 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.2 |
3.1 | 422 |
| 3 |
13.5* |
41.9* |
28.1* |
5.2* |
8.6 |
0.6 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.6 | 327 |
| B |
3.9* |
56.4* |
37.3* |
2.0* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 204 |
| A |
5.4* |
51.4* |
37.8* |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
32.0* |
2.0* |
2.0* |
64.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
39.5* |
3.5* |
2.3* |
12.8* |
32.6 |
1.2 |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
2.4 | 86 |
| M |
17.8* |
8.9* |
35.6* |
11.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
24.5 | 45 |
| |
| Base Pair (2842:2875)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
47.9* |
6.8* |
18.6* |
17.9* |
1.2 |
2.8 |
-- |
0.5 |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
2.7 | 424 |
| 3 |
59.3* |
8.2* |
8.2* |
19.1* |
1.2 |
0.6 |
-- |
0.6 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
1.2 | 329 |
| B |
49.3* |
7.3* |
13.2* |
28.8* |
0.5 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 205 |
| A |
65.8* |
28.9* |
-- |
2.6* |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
4.0* |
2.0* |
70.0* |
4.0* |
-- |
20.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
80.2* |
1.2 |
-- |
3.5 |
3.5 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.7* |
3.6 | 86 |
| M |
13.3* |
2.2* |
37.8* |
24.4* |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
17.8 | 45 |
| |
| Base Pair (2843:2874)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
73.2* |
8.9* |
1.6* |
4.7* |
1.4 |
4.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
1.4 |
3.1 | 425 |
| 3 |
91.2* |
2.1* |
-- |
0.9 |
1.5 |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
1.2* |
1.5 | 330 |
| B |
93.2* |
3.4* |
-- |
1.0* |
1.0 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
58.0* |
-- |
10.0* |
-- |
32.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
82.8* |
-- |
-- |
1.1 |
3.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
1.1 |
4.6* |
5.6 | 87 |
| M |
22.2* |
4.4* |
15.6* |
26.7* |
2.2 |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
4.4 |
20.0 | 45 |
| |
|
| Base Pair (2844:2872) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
7.0 |
0.7 |
2.6 |
3.0 |
3.5 |
0.7 |
7.7 |
-- |
33.7* |
0.5 |
0.7* |
-- |
13.8* |
4.4 |
0.7 |
16.4* |
4.4 | 427 |
| 3 |
9.0 |
0.9 |
2.1 |
0.9 |
4.2 |
0.9 |
4.5 |
-- |
30.1* |
-- |
0.9* |
-- |
17.2* |
5.7 |
0.3 |
20.8* |
2.4 | 332 |
| B |
0.5 |
-- |
0.5 |
1.0 |
3.4 |
1.0 |
7.3 |
-- |
48.8* |
-- |
-- |
-- |
27.8* |
9.3 |
-- |
-- |
0.5 | 205 |
| A |
73.7* |
7.9* |
5.3* |
-- |
13.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
-- |
-- |
4.0* |
4.0 |
2.0* |
-- |
8.0 |
-- |
82.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
1.1 |
-- |
4.5 |
1.1 |
2.2 |
1.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4* |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
77.5* |
7.9 | 89 |
| M |
-- |
-- |
4.4 |
17.8 |
-- |
-- |
31.1* |
-- |
6.7 |
4.4 |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
4.4* |
2.2 |
24.5 | 45 |
| |
| Base Pair (2845:2871) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
20.7* |
2.6 |
2.6 |
20.2 |
17.8 |
2.8 |
-- |
0.2 |
5.2* |
0.5* |
-- |
0.9 |
-- |
1.2 |
-- |
23.2* |
2.1 | 426 |
| 3 |
21.5* |
3.3 |
-- |
16.0 |
19.0 |
3.0 |
-- |
-- |
6.6* |
0.3* |
-- |
0.6 |
-- |
0.3 |
-- |
29.0* |
0.3 | 331 |
| B |
6.3* |
3.9 |
-- |
3.4 |
29.3 |
-- |
-- |
-- |
10.7* |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
45.9* |
-- | 205 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
30.0* |
-- |
4.0* |
42.0* |
16.0 |
2.0 |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
22.7* |
3.4 |
-- |
52.3* |
3.4 |
11.4* |
-- |
-- |
-- |
1.1* |
-- |
1.1 |
-- |
1.1 |
-- |
2.3 |
1.1 | 88 |
| M |
4.4 |
-- |
20.0* |
26.7* |
11.1 |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
8.9* |
-- |
6.7 |
17.8 | 45 |
| |
| Base Pair (2846:2870)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
65.5* |
6.3* |
14.1* |
7.3* |
0.5 |
2.3 |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
0.5 |
2.3 | 426 |
| 3 |
64.4* |
8.2* |
17.2* |
5.7* |
0.3 |
2.4 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.3 |
0.6 | 331 |
| B |
88.3* |
6.8* |
-- |
4.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 205 |
| A |
78.9* |
-- |
-- |
21.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
98.0* |
-- |
-- |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
2.3* |
14.8* |
64.8* |
2.3* |
1.1 |
9.1 |
-- |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.1 |
1.1 |
1.1 | 88 |
| M |
37.8* |
-- |
6.7* |
24.4* |
2.2 |
4.4 |
-- |
2.2 |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
17.8 | 45 |
| |
|
| Base Pair (2849:2866) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
1.8 |
3.8 |
-- |
0.4* |
0.2 |
0.2* |
-- |
0.9 |
0.4 |
26.2* |
1.1 |
57.5* |
6.7 | 447 |
| 3 |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
2.0 |
2.6 |
-- |
-- |
0.3 |
0.3* |
-- |
0.9 |
0.6 |
30.4* |
0.3 |
59.4* |
3.2 | 352 |
| B |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.4 |
1.5 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 |
1.0 |
51.7* |
-- |
41.0* |
-- | 205 |
| A |
-- |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
10.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
78.9 |
7.9 | 38 |
| C |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
10.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
20.0* |
-- |
68.0* |
-- | 50 |
| E |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
0.9* |
-- |
0.9 |
-- |
0.9* |
0.9 |
87.2* |
7.4 | 109 |
| M |
-- |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
6.7 |
-- |
4.4* |
-- |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
8.9 |
31.1* |
42.2 | 45 |
| |
|
| Base Pair (2852:2865)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
17.9 |
1.1* |
1.6* |
6.5 |
62.2* |
-- |
0.2 |
0.4* |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.9 |
0.7 |
0.4 |
-- |
2.7 |
4.6 | 447 |
| 3 |
22.2 |
1.4* |
-- |
2.3 |
67.6* |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.3 |
1.1 |
0.3 |
0.6 |
-- |
2.3 |
1.8 | 352 |
| B |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 |
95.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.4 |
1.0 | 205 |
| A |
7.9 |
10.5* |
-- |
-- |
81.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
4.0 |
-- |
-- |
34.0 |
56.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
4.0 | 50 |
| E |
67.9* |
0.9* |
-- |
5.5* |
11.0 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
0.9 |
3.7 |
0.9 |
1.8 |
-- |
2.8 |
3.6 | 109 |
| M |
-- |
-- |
15.6* |
8.9 |
26.7* |
-- |
2.2 |
4.4* |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
4.4 |
-- |
-- |
6.7 |
28.8 | 45 |
| |
| Base Pair (2853:2864)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.7* |
42.3* |
38.3* |
7.6* |
1.8 |
0.4 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.9 |
0.4 |
0.7 |
4.3 | 447 |
| 3 |
1.1* |
51.1* |
39.8* |
2.0* |
0.9 |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
1.1 |
0.6 |
0.9 |
2.1 | 352 |
| B |
2.0* |
54.9* |
38.7* |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 | 204 |
| A |
-- |
92.1* |
5.3* |
-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 38 |
| C |
14.0* |
-- |
46.0* |
24.0* |
10.0 |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 | 50 |
| E |
-- |
30.0* |
53.6* |
0.9 |
1.8* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
2.7 |
1.8 |
2.7 |
4.5 | 110 |
| M |
2.2* |
20.0* |
17.8* |
33.3* |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.4 | 45 |
| |
| Base Pair (2854:2863)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
41.4* |
6.0* |
5.6* |
27.7* |
8.5 |
3.6 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
0.9 |
4.8 | 447 |
| 3 |
51.1* |
5.4* |
3.4* |
27.8* |
5.4 |
0.9 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.6 |
1.1 |
3.2 | 352 |
| B |
59.0* |
3.4* |
4.4* |
25.9* |
5.9 |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 205 |
| A |
36.8* |
31.6* |
7.9* |
10.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.9 |
5.3 | 38 |
| C |
8.0 |
10.0 |
14.0 |
16.0 |
32.0* |
20.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
41.3* |
-- |
-- |
37.6* |
6.4 |
-- |
-- |
1.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
1.8 |
0.9 |
8.2 | 109 |
| M |
2.2* |
6.7* |
13.3* |
40.0* |
6.7 |
6.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
24.4 | 45 |
| |
| Base Pair (2855:2862)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.8* |
39.7* |
23.8* |
3.4* |
0.4 |
1.8 |
0.2 |
0.2 |
-- |
0.2 |
1.8 |
-- |
0.7 |
-- |
3.6 |
0.7 |
4.5 | 446 |
| 3 |
22.8* |
37.3* |
22.2* |
4.3* |
0.6 |
1.4 |
0.3 |
0.3 |
-- |
0.3 |
2.3 |
-- |
0.9 |
-- |
4.6 |
0.9 |
2.1 | 351 |
| B |
2.9* |
53.4* |
35.3* |
5.9* |
-- |
1.5 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 | 204 |
| A |
13.2* |
52.6* |
15.8* |
7.9* |
-- |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
7.9 |
-- | 38 |
| C |
-- |
74.0* |
22.0* |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
63.3* |
1.8* |
-- |
-- |
1.8 |
0.9 |
0.9* |
0.9 |
-- |
-- |
7.3 |
-- |
2.8 |
-- |
14.7 |
-- |
5.4 | 109 |
| M |
8.9* |
20.0* |
37.8* |
-- |
-- |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
31.1 | 45 |
| |
| Base Pair (2856:2861)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
18.2* |
13.7* |
2.5* |
54.7* |
0.2 |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.7 |
5.3 | 446 |
| 3 |
20.8* |
14.2* |
0.3* |
53.8* |
0.3 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
0.9 |
3.8 | 351 |
| B |
33.8* |
7.8 |
-- |
47.5* |
0.5 |
8.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
1.0 | 204 |
| A |
10.5* |
86.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.6 | 38 |
| C |
2.0* |
-- |
-- |
98.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 50 |
| E |
-- |
0.9* |
0.9* |
84.4* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 |
9.2 | 109 |
| M |
15.6* |
24.4* |
22.2* |
13.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
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-- |
-- |
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24.4 | 45 |
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