23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 31
| Base Pair (31:474)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
15.0* |
45.6* |
17.6* |
7.4* |
0.1 |
0.6 |
0.9 |
0.4 |
0.4 |
5.6 |
0.3 |
0.1 |
2.4 |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
2.7 | 678 |
| 3 |
9.7* |
62.3* |
16.7* |
8.2* |
0.2 |
0.7 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 401 |
| B |
-- |
98.4* |
1.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 249 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
6.5* |
87.0* |
6.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 46 |
| E |
2.6* |
4.3* |
55.2* |
28.4* |
0.9 |
2.6 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 116 |
| M |
26.0* |
8.2* |
21.2* |
7.4* |
-- |
0.4 |
2.6 |
1.3 |
0.9 |
16.5 |
0.9 |
-- |
6.9 |
0.4 |
0.4 |
1.3 |
5.6 | 231 |
| |
| Base Pair (32:473)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
-- |
90.6* |
1.5* |
2.3* |
0.1 |
0.7 |
0.1 |
-- |
-- |
1.5 |
0.3 |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.1 |
2.1 | 681 |
| 3 |
-- |
96.0* |
0.2* |
2.5* |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.4 | 403 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 251 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 46 |
| E |
-- |
87.1* |
0.9* |
8.6* |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
1.8 | 116 |
| M |
-- |
79.3* |
3.9* |
2.6* |
0.4 |
1.7 |
0.4 |
-- |
-- |
4.3 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
5.6 | 232 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)