23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 317
| Base Pair (317:334) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
34.1* |
3.9* |
2.0* |
27.9* |
4.6 |
0.8 |
-- |
0.1 |
0.2 |
-- |
0.4 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
25.5 | 889 |
| 3 |
52.7* |
6.5* |
3.4* |
27.5* |
7.1 |
1.3 |
-- |
0.2 |
0.4 |
-- |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 535 |
| B |
57.7* |
0.4* |
-- |
38.8* |
2.5 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
80.6* |
-- |
-- |
11.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
6.0* |
-- |
-- |
90.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
3.0 | 100 |
| E |
41.7* |
15.6* |
8.3* |
15.6* |
14.2 |
2.8 |
-- |
0.5 |
0.9 |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 218 |
| M |
5.9* |
-- |
-- |
4.3* |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
88.2 | 254 |
| |
| Base Pair (318:333) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.8* |
56.0* |
9.8* |
1.8* |
0.2 |
3.0 |
0.7 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
25.4 | 889 |
| 3 |
3.0* |
71.2* |
15.7* |
2.6* |
0.4 |
4.9 |
0.6 |
-- |
0.2 |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
0.2 | 535 |
| B |
3.2* |
82.1* |
6.8* |
1.8* |
-- |
6.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 280 |
| A |
5.6* |
80.6* |
13.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
-- |
92.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
1.0 |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
2.3* |
55.7* |
27.4* |
4.1* |
0.9 |
4.1 |
1.4 |
-- |
0.5 |
-- |
1.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
0.5 | 219 |
| M |
-- |
9.8* |
0.4* |
0.8* |
-- |
0.4 |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.8 | 254 |
| |
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)