23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 325
| Base Pair (325:337)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
44.4* |
4.7* |
8.0* |
11.9* |
2.0 |
0.2 |
1.7 |
0.1 |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.1 |
0.4 |
0.1 |
25.8 | 891 |
| 3 |
71.3* |
7.3* |
0.4* |
13.4* |
3.4 |
0.2 |
2.0 |
0.2 |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
0.2 |
-- |
0.2 |
0.7 | 537 |
| B |
64.8* |
6.8* |
-- |
22.8* |
4.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
0.4 |
0.4 | 281 |
| A |
97.2* |
-- |
-- |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
6.0* |
3.0* |
68.0* |
15.0* |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 |
-- |
3.0 | 100 |
| E |
75.5* |
9.1* |
0.9 |
3.2 |
2.7 |
0.5 |
5.0* |
0.5 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
1.4 | 220 |
| M |
2.8* |
-- |
0.4* |
7.5* |
-- |
-- |
1.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
87.8 | 254 |
| |
| Base Pair (326:336)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
68.7* |
0.7* |
0.8* |
4.2* |
0.2 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
25.4 | 891 |
| 3 |
92.0* |
1.1* |
0.7* |
6.0* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 537 |
| B |
94.7* |
1.4* |
-- |
3.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 281 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
91.0* |
-- |
1.0* |
4.0* |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
87.3* |
0.9* |
1.8* |
9.5* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 220 |
| M |
10.6* |
-- |
0.8* |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.2 | 254 |
| |
| Base Pair (327:335)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
71.8* |
0.2* |
-- |
1.8* |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
-- |
25.7 | 891 |
| 3 |
96.1* |
0.4* |
-- |
2.6* |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.6 | 537 |
| B |
99.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 | 281 |
| A |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
| C |
96.0* |
-- |
-- |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.0 | 100 |
| E |
91.4* |
0.9* |
-- |
6.4* |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
0.5 | 220 |
| M |
11.0* |
-- |
-- |
0.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
87.8 | 254 |
| |
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