23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 413
| Base Pair (413:2410) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
47.7* |
1.4* |
20.4* |
1.4 |
-- |
0.3 |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
27.9 | 771 |
| 3 |
0.2* |
57.3* |
1.4* |
37.2* |
2.6 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
-- | 419 |
| B |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| A |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
99.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
0.7* |
5.3* |
4.0* |
79.3* |
7.3 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
0.7 |
1.3 |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
12.2* |
1.6* |
0.4* |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.2 | 254 |
| |
| Base Pair (414:2409) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.2* |
48.4* |
4.0* |
15.0* |
0.4 |
1.4 |
-- |
0.1 |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
27.8 | 771 |
| 3 |
4.1* |
58.5* |
6.7* |
27.4* |
0.7 |
1.7 |
-- |
-- |
0.2 |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.2 | 419 |
| B |
-- |
99.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 232 |
| A |
-- |
37.8* |
35.1* |
-- |
5.4* |
18.9 |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.9* |
1.0* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
11.3* |
-- |
10.0* |
76.7* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
13.0* |
0.8* |
0.4* |
-- |
0.8 |
-- |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.2 | 254 |
| |
| Base Pair (415:2408) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
1.9* |
8.4* |
13.5* |
47.3* |
0.1 |
0.3 |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
27.8 | 771 |
| 3 |
3.6* |
15.5* |
23.2* |
56.3* |
0.2 |
0.5 |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 419 |
| B |
-- |
-- |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 232 |
| A |
18.9* |
56.8* |
13.5* |
-- |
2.7 |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
-- |
-- |
98.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 98 |
| E |
5.3* |
29.3* |
61.3* |
2.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 150 |
| M |
-- |
-- |
2.8* |
13.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.3 | 254 |
| |
| Base Pair (416:2407) (Tertiary)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.3* |
31.3* |
32.3* |
2.2* |
0.8 |
2.6 |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
27.7 | 772 |
| 3 |
4.3* |
31.0* |
54.5* |
2.9* |
1.4 |
4.8 |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- | 420 |
| B |
-- |
44.2* |
55.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 233 |
| A |
35.1* |
2.7* |
18.9* |
21.6* |
16.2 |
-- |
-- |
5.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
96.9* |
3.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 98 |
| E |
3.3* |
17.3* |
61.3* |
2.7* |
-- |
13.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- | 150 |
| M |
-- |
6.7* |
6.7* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
84.8 | 254 |
| |
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