23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 46
Base Pair (46:179)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
24.2* |
16.1* |
2.9 |
0.6 |
-- |
0.1 |
5.3* |
-- |
3.9 |
0.7 |
-- |
-- |
0.7 |
0.3 |
0.1 |
0.7* |
44.1 | 714 |
3 |
40.0* |
28.6* |
4.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
26.5 | 402 |
B |
63.6* |
32.4* |
2.8* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
0.4 | 250 |
A |
5.6* |
94.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
10.1* |
-- |
3.8 |
-- |
-- |
1.3* |
44.3* |
-- |
34.2 |
2.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.8 | 79 |
E |
-- |
-- |
8.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
91.4 | 116 |
M |
1.7 |
-- |
0.4 |
1.7 |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
0.4* |
1.3 |
-- |
-- |
2.1* |
-- |
0.4 |
2.1* |
88.3 | 233 |
|
Base Pair (47:178)
| Collective Score |
Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
T |
0.1 |
64.3* |
0.8* |
0.6 |
0.7* |
1.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
32.1 | 711 |
3 |
-- |
95.7* |
1.0* |
0.5* |
-- |
2.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 | 399 |
B |
-- |
98.8 |
-- |
-- |
-- |
1.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 249 |
A |
-- |
69.4* |
8.3* |
5.6* |
-- |
16.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 36 |
C |
-- |
94.9* |
1.3* |
-- |
-- |
-- |
1.3 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.5 | 79 |
E |
-- |
97.4* |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 | 114 |
M |
0.4 |
-- |
0.4* |
0.9 |
2.1* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
96.1 | 233 |
|
Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)