23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 46


Base Pair (46:179)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 24.2* 16.1* 2.9 0.6 -- 0.1 5.3* -- 3.9 0.7 -- -- 0.7 0.3 0.1 0.7* 44.1714
3 40.0* 28.6* 4.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.5 -- -- 26.5402
B 63.6* 32.4* 2.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.8 -- -- 0.4250
A 5.6* 94.4* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C 10.1* -- 3.8 -- -- 1.3* 44.3* -- 34.2 2.5 -- -- -- -- -- -- 3.879
E -- -- 8.6 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 91.4116
M 1.7 -- 0.4 1.7 -- -- 1.3 -- 0.4* 1.3 -- -- 2.1* -- 0.4 2.1* 88.3233
 
Base Pair (47:178)   Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.1 64.3* 0.8* 0.6 0.7* 1.3 0.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 32.1711
3 -- 95.7* 1.0* 0.5* -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.6399
B -- 98.8 -- -- -- 1.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --249
A -- 69.4* 8.3* 5.6* -- 16.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- --36
C -- 94.9* 1.3* -- -- -- 1.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.579
E -- 97.4* 0.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.8114
M 0.4 -- 0.4* 0.9 2.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 96.1233
 

Last generated : Mon Jul 2 2001 (16 : 9)