23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 461
| Base Pair (461:468)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
4.9* |
89.9* |
1.4* |
0.9* |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
-- |
0.1 |
0.1 |
0.4 |
-- |
0.1 |
1.3 | 905 |
| 3 |
8.0* |
89.1* |
-- |
0.4* |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
0.2 |
0.7 |
-- |
0.2 |
0.4 | 549 |
| B |
-- |
99.6* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4* |
-- | 282 |
| A |
24.3* |
73.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
97.0* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
15.2* |
78.7* |
-- |
0.9* |
2.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
0.4 |
1.3 |
-- |
-- |
0.9 | 230 |
| M |
-- |
89.1* |
4.7* |
2.3* |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 256 |
| |
| Base Pair (462:467)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
78.4* |
15.1* |
3.6* |
-- |
0.3 |
-- |
-- |
-- |
0.3 |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.6 | 906 |
| 3 |
0.5* |
75.8* |
17.1* |
4.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.5 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.7 | 550 |
| B |
0.4* |
78.7* |
19.1* |
0.7* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 282 |
| A |
5.4* |
75.7* |
16.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
89.0* |
4.0* |
5.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.0 | 100 |
| E |
-- |
72.3* |
14.7* |
10.4* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.7 | 231 |
| M |
0.4* |
79.7* |
15.2* |
0.8* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
3.5 | 256 |
| |
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