23S rRNA Model Base Pair Frequencies for Helical Element 484
| Base Pair (484:496)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.3* |
64.0* |
1.0* |
1.2* |
0.2 |
0.1 |
-- |
-- |
0.3 |
1.2 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
29.9 | 891 |
| 3 |
-- |
89.9* |
0.2 |
0.4 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
2.1 |
0.7 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
0.9* |
5.0 | 535 |
| B |
-- |
95.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
0.7 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8* |
1.8 | 279 |
| A |
-- |
78.4* |
-- |
5.4* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
13.5 |
2.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
82.0* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
3.0 |
-- |
-- |
-- |
1.0 |
10.0 | 100 |
| E |
-- |
85.4* |
0.5* |
-- |
0.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.8 |
0.9 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 | 219 |
| M |
1.2* |
2.7* |
2.3* |
3.5* |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
89.5 | 256 |
| |
| Base Pair (485:495)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.4* |
46.6* |
22.8* |
1.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
0.3 |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
28.4 | 891 |
| 3 |
0.6* |
58.3* |
35.9* |
0.2* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.6 |
0.2 |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.3 | 535 |
| B |
-- |
96.8* |
2.9* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 | 279 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
92.0* |
1.0* |
3.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
4.0 | 100 |
| E |
1.4* |
2.3* |
84.0* |
0.5* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
1.4 |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 | 219 |
| M |
0.4* |
4.3* |
3.9* |
2.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
88.7 | 256 |
| |
| Base Pair (486:494)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
2.5* |
48.2* |
1.9* |
0.2* |
-- |
18.0 |
-- |
0.1 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.1 |
28.9 | 892 |
| 3 |
3.5* |
60.4* |
1.1* |
-- |
-- |
29.7 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
5.2 | 536 |
| B |
6.8* |
90.4* |
0.7* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.2 | 280 |
| A |
-- |
100.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- | 37 |
| C |
-- |
92.0* |
4.0* |
-- |
-- |
2.0 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
15.5 |
1.8 |
-- |
-- |
72.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 | 219 |
| M |
1.2* |
5.5* |
2.7* |
0.8* |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
89.1 | 256 |
| |
| Base Pair (487:493)
| Collective Score |
| Aln
| GC
| CG
| UA
| AU
| GU
| UG
| AA
| AC
| AG
| CA
| CC
| CU
| GA
| GG
| UC
| UU
| gap
| Seq
|
|---|
| T |
0.1* |
37.5* |
28.3* |
2.2* |
-- |
0.8 |
0.1 |
-- |
-- |
0.6 |
-- |
-- |
0.1 |
0.1 |
-- |
-- |
30.1 | 889 |
| 3 |
0.2* |
44.5* |
43.5* |
3.4* |
-- |
0.8 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
0.2 |
-- |
-- |
6.6 | 533 |
| B |
0.4* |
72.3* |
18.0* |
4.3* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
4.3 | 278 |
| A |
-- |
80.6* |
2.8* |
-- |
-- |
8.3 |
-- |
-- |
-- |
5.6 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.8 | 36 |
| C |
-- |
89.0* |
9.0* |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
2.0 | 100 |
| E |
-- |
3.2* |
82.6* |
2.7* |
-- |
0.5 |
-- |
-- |
-- |
0.9 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
10.0 | 219 |
| M |
-- |
2.7* |
4.3* |
0.8* |
-- |
1.2 |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
-- |
-- |
0.4 |
-- |
-- |
-- |
90.2 | 256 |
| |
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